Artemisa:

__NOTOC__ __NOEDITSECTION__
<languages />

==Registration==
O registado é o processo mediante o qual se sobrepõem de forma coincidente duas imagens médicas tomadas em momentos temporários diferentes, correspondentes à mesma parte do corpo e geralmente ao mesmo paciente, a fim de poder comprovar a evolução de uma lesão/doença/operação.

Mediante esta comparação de imagem estudam-se as diferenças entre ambas, mas para que isto seja possível da maneira mais intuitiva possível se tem de conseguir a coincidência por sobreposição o mais exacta possível. Isto tem de se fazer com duas imagens que, além de ter sido tomadas em momentos temporários diferentes, podem provir de equipas diferentes (outro modelo de scanner, por exemplo) e nos que não se pode garantir que a posição na que estava colocado o paciente tem sido exactamente a mesma (variações em orientação e deslocação).

Un resumen de los posibles escenarios de registrado es:
*estructuras anatómicas cuasi coincidentes: dos imágenes en las que las mismas estructuras anatómicas, de tamaño similar, están presentes en ambas.
*variaciones en la talla del paciente: particularmente en el caso de niños, donde el crecimiento natural hace que existan diferencias de tamaño del cuerpo entero.
*estructuras anatómicas con volúmenes diferentes: cuando se va a estudiar la evolución de una masa tumoral que ha ido creciendo con el tiempo, esta ha aumentado de volumen en una de las imágenes (puede ser la más reciente o la más antigua) y puede que haya desplazado a otras estructuras anatómicas u órganos colindantes.
*estructuras anatómicas inexistentes: tras una cirugía (o tratamiento) en la que se ha practicado una extirpación de parte de tejido (órgano, tumor, hueso, etc...) se han de cotejar pares de en las que hay elementos que no existen en una de las imágenes.

===Descrição do procedimento===

En líneas generales el procedimiento a seguir es el de cargar ambas imágenes una junto a la otra, identificar puntos comunes en cada una (los puntos van emparejados, se toma uno en la imagen A y otro en la imagen B. Si ambas imágenes presentan la misma orientación, no será necesario aplicar distorsión alguna para hacerlas coincidir; pero esto no suele ser lo más común. Entonces se ha de seleccionar cual de las dos imágenes con las que se trabaja (A o B) se va a aplicar una distorsión para lograr la coincidencia plena.

A la hora de determinar los puntos comunes en ambas imágenes, puede ser necesario moverse entre las diferentes slices de las tres vistas disponibles para que en la imagen A y B se esté mostrando la misma información anatómica.

===Módulos===

Os módulos de registado podem-se encontrar na metade inferior do desdobrável de módulos (<xr id="fig:Registrado" />), estão agrupados baixo o nome ''Registration'':

<figure id="fig:Registrado">
[[File:Reg01.png|none|thumb|<caption>registration modules</caption>]]
</figure>

Tradicionalmente utilizou-se o registado em imagens cerebrais, daí que vários dos módulos estejam orientados a estes casos específicos.

====Terminología====
* Landmark: puntos representativos de la imagen (seleccionados por el usuario en ambas imágenes) para asegurar la coincidencia
* Fixed volume: imagen que no va a sufrir transformación alguna
* Moving volume: imagen que se va a transformar para hacerla coincidir con la que se ha seleccionado como ''fixed volume''

==Ejemplo: landmark registration==
===Carga de volúmenes===
Una vez cargados los dos juegos de imágenes, se abre el módulo '''Registration\Landmark registration'''. En ese momento el módulo pide al usuario que determine cual va a ser el ''fixed volume'' y el ''moving volume'' (<xr id="fig:Registrado2" />) utilizando los desplegables, al hacer click en cada uno de ellos se puede ver cuales son los volúmenes cargados en la escena actual y seleccionar el que corresponda.

<figure id="fig:Registrado2">
[[File:Reg02.png|none|thumb|<caption>fixed and moving volumes</caption>]]
</figure>

La distribución de la pantalla cambia y pasa a ser una rejilla de 3x3 (<xr id="fig:Registrado3" />). Por columnas, se muestran las vistas axial, coronal y sagital en las columnas 1, 2 y 3 (esta es la distribución por defecto, a no ser que el usuario decida modificarlo). Por filas se muestra el ''fixed volume'' en la fila 1, el ''moving volume'' en la fila 2 y el resultado de la superposición de ambos en la fila 3, que pasará a llamarse ''-transformed''.

<figure id="fig:Registrado3">
[[File:Reg03.png|none|thumb|<caption>registration layout</caption>]]
</figure>

===Selección layout===
Si se desea modificar este layout, se hará desde el panel del módulo, modificando las siguientes opciones (<xr id="fig:Registrado4" />). Si no fuera relevante alguna de las vistas se puede desactivar y así no ocupa espacio en pantalla, controlar la transparencia de la superposición de imágenes e incluso el zoom:

Translations:Registrado/17/pt
<figure id="fig:Registrado4">
[[File:Reg04.png|none|thumb|<caption>layout</caption>]]
</figure>

También, si se desea cambiar los volúmenes con los que se esté trabajando, un poco más arriba en el panel del módulo, utilizando el botón '''Select Volumes to Register''' se vuelve al menú de selección descrito en <xr id="fig:Registrado2" />.

Por exemplo, seleccionando ''Coronal'' o layout fica assim (<xr id="fig:Registrado5" />):

<figure id="fig:Registrado5">
[[File:Reg05.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

===Landmarks===
Los puntos de cotejamiento, o landmarks, se añaden en el apartado ''Landmarks'' del panel del módulo, situado justo debajo de los descritos anteriormente (<xr id="fig:Registrado6" />).

<figure id="fig:Registrado6">
[[File:Reg06.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

Se pulsa el botón ADD y se sitúa el punto (el cursor cambia automáticamente y pasamos a estar en modo fiducials) en el ''fixed volume'' haciendo click en el lugar deseado. El programa situará automáticamente ese mismo punto (llamado L-0 en la imagen de ejemplo) en el ''moving volume''. Lo ideal es que estos puntos se coloquen en elementos representativos de ambas imágenes y que sean fácilmente identificables.

Ahora, tal y como se ve en la imagen (<xr id="fig:Registrado7" />), el usuario ha puesto el punto en la vista de la primera columna (verde) y Slicer ha puesto el punto en la vista de la segunda columna (amarilla). El landmark de la ''moving volume'' no está en el mismo lugar que el de la imagen de la ''fixed volume'' (Slicer simplemente lo sitúa en las mismas coordenadas, sin tener en cuenta la imagen y lo que en ella se representa), así que para corregir su localización se hace click en el botón REFINE LANDMARK que está justo debajo de la lista de landmarks presentes en el registrado actual. Entonces podremos desplazar manualmente, pinchando y arrastrando, el landmark del ''moving volume'' hasta la posición que consideremos visualmente correcta.

<figure id="fig:Registrado7">
[[File:Reg07.png|none|thumb|<caption>landmak point</caption>]]
</figure>

Se continúa añadiendo landmarks hasta considerar que se han puesto los necesarios para el ajuste correcto de ambas imágenes, en este punto del proceso de trabajo dispondremos de un conjunto de puntos (<xr id="fig:Registrado8" />), que vienen definidos por su nombre. Se pueden seleccionar haciendo click en el cursor con el icono del ''crosshair'' y eliminarse con el icono de la papelera.

<figure id="fig:Registrado8">
[[File:Reg08.png|none|thumb|<caption>landmak list</caption>]]
</figure>

El refinado de los landmarks puede apoyarse en dos métodos de refinamiento, BRAINSFit y SimpleITK, pero ninguno de estos métodos suple al operador y a su criterio.

===Registration===

No existe un canon que determine el método de registrado a aplicar, puesto que depende de diferentes factores en cada caso, como pueden ser el tipo de imágenes con las que se trabaje, la calidad de las mismas, la anatomía que se esté visualizando y los resultados esperados. Un método estándard y bastante abierto a configuración por parte del usuario es el de la '''Affine Registration'' (<xr id="fig:Registrado9" />), que permite estos tres niveles de ajuste:
*Rigid: permite traslaciones y rotaciones
*Similarity: rigid + cambios de escala uniforme
*Affine: Similarity + deformación
La transformación afín se denomina también transformación lineal y viene definida por diferentes matrices para pasar de un conjunto de coordenadas iniciales a otras [[https://en.wikipedia.org/wiki/Affine_transformation| Wikpedia Affine Transformation]].

<figure id="fig:Registrado9">
[[File:Reg09.png|none|thumb|<caption>linear registration</caption>]]
</figure>

Dependendo da qualidade e quantidade de landmarks seleccionados o registado será mais ou menos exacto e é tarefa do operador ir refinando os landmarks para que o resultado seja o mais óptimo possível.

<hr>
[[Clínicos 3D Slicer/pt| MENU]]

Registrado/pt

2018-09-27T18:24:13Z

Artemisa: Página creada con «Dependendo da qualidade e quantidade de landmarks seleccionados o registado será mais ou menos exacto e é tarefa do operador ir refinando os landmarks para que o resultad...»

__NOTOC__ __NOEDITSECTION__
<languages />

==Registado==
O registado é o processo mediante o qual se sobrepõem de forma coincidente duas imagens médicas tomadas em momentos temporários diferentes, correspondentes à mesma parte do corpo e geralmente ao mesmo paciente, a fim de poder comprovar a evolução de uma lesão/doença/operação.

Mediante esta comparação de imagem estudam-se as diferenças entre ambas, mas para que isto seja possível da maneira mais intuitiva possível se tem de conseguir a coincidência por sobreposição o mais exacta possível. Isto tem de se fazer com duas imagens que, além de ter sido tomadas em momentos temporários diferentes, podem provir de equipas diferentes (outro modelo de scanner, por exemplo) e nos que não se pode garantir que a posição na que estava colocado o paciente tem sido exactamente a mesma (variações em orientação e deslocação).

Un resumen de los posibles escenarios de registrado es:
*estructuras anatómicas cuasi coincidentes: dos imágenes en las que las mismas estructuras anatómicas, de tamaño similar, están presentes en ambas.
*variaciones en la talla del paciente: particularmente en el caso de niños, donde el crecimiento natural hace que existan diferencias de tamaño del cuerpo entero.
*estructuras anatómicas con volúmenes diferentes: cuando se va a estudiar la evolución de una masa tumoral que ha ido creciendo con el tiempo, esta ha aumentado de volumen en una de las imágenes (puede ser la más reciente o la más antigua) y puede que haya desplazado a otras estructuras anatómicas u órganos colindantes.
*estructuras anatómicas inexistentes: tras una cirugía (o tratamiento) en la que se ha practicado una extirpación de parte de tejido (órgano, tumor, hueso, etc...) se han de cotejar pares de en las que hay elementos que no existen en una de las imágenes.

===Descrição do procedimento===

En líneas generales el procedimiento a seguir es el de cargar ambas imágenes una junto a la otra, identificar puntos comunes en cada una (los puntos van emparejados, se toma uno en la imagen A y otro en la imagen B. Si ambas imágenes presentan la misma orientación, no será necesario aplicar distorsión alguna para hacerlas coincidir; pero esto no suele ser lo más común. Entonces se ha de seleccionar cual de las dos imágenes con las que se trabaja (A o B) se va a aplicar una distorsión para lograr la coincidencia plena.

A la hora de determinar los puntos comunes en ambas imágenes, puede ser necesario moverse entre las diferentes slices de las tres vistas disponibles para que en la imagen A y B se esté mostrando la misma información anatómica.

===Módulos===

Os módulos de registado podem-se encontrar na metade inferior do desdobrável de módulos (<xr id="fig:Registrado" />), estão agrupados baixo o nome ''Registration'':

<figure id="fig:Registrado">
[[File:Reg01.png|none|thumb|<caption>registration modules</caption>]]
</figure>

Tradicionalmente utilizou-se o registado em imagens cerebrais, daí que vários dos módulos estejam orientados a estes casos específicos.

====Terminología====
* Landmark: puntos representativos de la imagen (seleccionados por el usuario en ambas imágenes) para asegurar la coincidencia
* Fixed volume: imagen que no va a sufrir transformación alguna
* Moving volume: imagen que se va a transformar para hacerla coincidir con la que se ha seleccionado como ''fixed volume''

==Ejemplo: landmark registration==
===Carga de volúmenes===
Una vez cargados los dos juegos de imágenes, se abre el módulo '''Registration\Landmark registration'''. En ese momento el módulo pide al usuario que determine cual va a ser el ''fixed volume'' y el ''moving volume'' (<xr id="fig:Registrado2" />) utilizando los desplegables, al hacer click en cada uno de ellos se puede ver cuales son los volúmenes cargados en la escena actual y seleccionar el que corresponda.

<figure id="fig:Registrado2">
[[File:Reg02.png|none|thumb|<caption>fixed and moving volumes</caption>]]
</figure>

La distribución de la pantalla cambia y pasa a ser una rejilla de 3x3 (<xr id="fig:Registrado3" />). Por columnas, se muestran las vistas axial, coronal y sagital en las columnas 1, 2 y 3 (esta es la distribución por defecto, a no ser que el usuario decida modificarlo). Por filas se muestra el ''fixed volume'' en la fila 1, el ''moving volume'' en la fila 2 y el resultado de la superposición de ambos en la fila 3, que pasará a llamarse ''-transformed''.

<figure id="fig:Registrado3">
[[File:Reg03.png|none|thumb|<caption>registration layout</caption>]]
</figure>

===Selección layout===
Si se desea modificar este layout, se hará desde el panel del módulo, modificando las siguientes opciones (<xr id="fig:Registrado4" />). Si no fuera relevante alguna de las vistas se puede desactivar y así no ocupa espacio en pantalla, controlar la transparencia de la superposición de imágenes e incluso el zoom:

Translations:Registrado/17/pt
<figure id="fig:Registrado4">
[[File:Reg04.png|none|thumb|<caption>layout</caption>]]
</figure>

También, si se desea cambiar los volúmenes con los que se esté trabajando, un poco más arriba en el panel del módulo, utilizando el botón '''Select Volumes to Register''' se vuelve al menú de selección descrito en <xr id="fig:Registrado2" />.

Por exemplo, seleccionando ''Coronal'' o layout fica assim (<xr id="fig:Registrado5" />):

<figure id="fig:Registrado5">
[[File:Reg05.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

===Landmarks===
Los puntos de cotejamiento, o landmarks, se añaden en el apartado ''Landmarks'' del panel del módulo, situado justo debajo de los descritos anteriormente (<xr id="fig:Registrado6" />).

<figure id="fig:Registrado6">
[[File:Reg06.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

Se pulsa el botón ADD y se sitúa el punto (el cursor cambia automáticamente y pasamos a estar en modo fiducials) en el ''fixed volume'' haciendo click en el lugar deseado. El programa situará automáticamente ese mismo punto (llamado L-0 en la imagen de ejemplo) en el ''moving volume''. Lo ideal es que estos puntos se coloquen en elementos representativos de ambas imágenes y que sean fácilmente identificables.

Ahora, tal y como se ve en la imagen (<xr id="fig:Registrado7" />), el usuario ha puesto el punto en la vista de la primera columna (verde) y Slicer ha puesto el punto en la vista de la segunda columna (amarilla). El landmark de la ''moving volume'' no está en el mismo lugar que el de la imagen de la ''fixed volume'' (Slicer simplemente lo sitúa en las mismas coordenadas, sin tener en cuenta la imagen y lo que en ella se representa), así que para corregir su localización se hace click en el botón REFINE LANDMARK que está justo debajo de la lista de landmarks presentes en el registrado actual. Entonces podremos desplazar manualmente, pinchando y arrastrando, el landmark del ''moving volume'' hasta la posición que consideremos visualmente correcta.

<figure id="fig:Registrado7">
[[File:Reg07.png|none|thumb|<caption>landmak point</caption>]]
</figure>

Se continúa añadiendo landmarks hasta considerar que se han puesto los necesarios para el ajuste correcto de ambas imágenes, en este punto del proceso de trabajo dispondremos de un conjunto de puntos (<xr id="fig:Registrado8" />), que vienen definidos por su nombre. Se pueden seleccionar haciendo click en el cursor con el icono del ''crosshair'' y eliminarse con el icono de la papelera.

<figure id="fig:Registrado8">
[[File:Reg08.png|none|thumb|<caption>landmak list</caption>]]
</figure>

El refinado de los landmarks puede apoyarse en dos métodos de refinamiento, BRAINSFit y SimpleITK, pero ninguno de estos métodos suple al operador y a su criterio.

===Registration===

No existe un canon que determine el método de registrado a aplicar, puesto que depende de diferentes factores en cada caso, como pueden ser el tipo de imágenes con las que se trabaje, la calidad de las mismas, la anatomía que se esté visualizando y los resultados esperados. Un método estándard y bastante abierto a configuración por parte del usuario es el de la '''Affine Registration'' (<xr id="fig:Registrado9" />), que permite estos tres niveles de ajuste:
*Rigid: permite traslaciones y rotaciones
*Similarity: rigid + cambios de escala uniforme
*Affine: Similarity + deformación
La transformación afín se denomina también transformación lineal y viene definida por diferentes matrices para pasar de un conjunto de coordenadas iniciales a otras [[https://en.wikipedia.org/wiki/Affine_transformation| Wikpedia Affine Transformation]].

<figure id="fig:Registrado9">
[[File:Reg09.png|none|thumb|<caption>linear registration</caption>]]
</figure>

Dependendo da qualidade e quantidade de landmarks seleccionados o registado será mais ou menos exacto e é tarefa do operador ir refinando os landmarks para que o resultado seja o mais óptimo possível.

<hr>
[[Clínicos 3D Slicer/pt| MENU]]

Translations:Registrado/32/pt

2018-09-27T18:24:13Z

Dependendo da qualidade e quantidade de landmarks seleccionados o registado será mais ou menos exacto e é tarefa do operador ir refinando os landmarks para que o resultado seja o mais óptimo possível.

Translations:Registrado/33/pt

2018-09-27T18:23:58Z

Artemisa: Página creada con «<hr> MENU»

<hr>
[[Clínicos 3D Slicer/pt| MENU]]

Registrado/pt

2018-09-27T18:23:58Z

Artemisa: Página creada con «<hr> MENU»

__NOTOC__ __NOEDITSECTION__
<languages />

==Registado==
O registado é o processo mediante o qual se sobrepõem de forma coincidente duas imagens médicas tomadas em momentos temporários diferentes, correspondentes à mesma parte do corpo e geralmente ao mesmo paciente, a fim de poder comprovar a evolução de uma lesão/doença/operação.

Mediante esta comparação de imagem estudam-se as diferenças entre ambas, mas para que isto seja possível da maneira mais intuitiva possível se tem de conseguir a coincidência por sobreposição o mais exacta possível. Isto tem de se fazer com duas imagens que, além de ter sido tomadas em momentos temporários diferentes, podem provir de equipas diferentes (outro modelo de scanner, por exemplo) e nos que não se pode garantir que a posição na que estava colocado o paciente tem sido exactamente a mesma (variações em orientação e deslocação).

Un resumen de los posibles escenarios de registrado es:
*estructuras anatómicas cuasi coincidentes: dos imágenes en las que las mismas estructuras anatómicas, de tamaño similar, están presentes en ambas.
*variaciones en la talla del paciente: particularmente en el caso de niños, donde el crecimiento natural hace que existan diferencias de tamaño del cuerpo entero.
*estructuras anatómicas con volúmenes diferentes: cuando se va a estudiar la evolución de una masa tumoral que ha ido creciendo con el tiempo, esta ha aumentado de volumen en una de las imágenes (puede ser la más reciente o la más antigua) y puede que haya desplazado a otras estructuras anatómicas u órganos colindantes.
*estructuras anatómicas inexistentes: tras una cirugía (o tratamiento) en la que se ha practicado una extirpación de parte de tejido (órgano, tumor, hueso, etc...) se han de cotejar pares de en las que hay elementos que no existen en una de las imágenes.

===Descrição do procedimento===

En líneas generales el procedimiento a seguir es el de cargar ambas imágenes una junto a la otra, identificar puntos comunes en cada una (los puntos van emparejados, se toma uno en la imagen A y otro en la imagen B. Si ambas imágenes presentan la misma orientación, no será necesario aplicar distorsión alguna para hacerlas coincidir; pero esto no suele ser lo más común. Entonces se ha de seleccionar cual de las dos imágenes con las que se trabaja (A o B) se va a aplicar una distorsión para lograr la coincidencia plena.

A la hora de determinar los puntos comunes en ambas imágenes, puede ser necesario moverse entre las diferentes slices de las tres vistas disponibles para que en la imagen A y B se esté mostrando la misma información anatómica.

===Módulos===

Os módulos de registado podem-se encontrar na metade inferior do desdobrável de módulos (<xr id="fig:Registrado" />), estão agrupados baixo o nome ''Registration'':

<figure id="fig:Registrado">
[[File:Reg01.png|none|thumb|<caption>registration modules</caption>]]
</figure>

Tradicionalmente utilizou-se o registado em imagens cerebrais, daí que vários dos módulos estejam orientados a estes casos específicos.

====Terminología====
* Landmark: puntos representativos de la imagen (seleccionados por el usuario en ambas imágenes) para asegurar la coincidencia
* Fixed volume: imagen que no va a sufrir transformación alguna
* Moving volume: imagen que se va a transformar para hacerla coincidir con la que se ha seleccionado como ''fixed volume''

==Ejemplo: landmark registration==
===Carga de volúmenes===
Una vez cargados los dos juegos de imágenes, se abre el módulo '''Registration\Landmark registration'''. En ese momento el módulo pide al usuario que determine cual va a ser el ''fixed volume'' y el ''moving volume'' (<xr id="fig:Registrado2" />) utilizando los desplegables, al hacer click en cada uno de ellos se puede ver cuales son los volúmenes cargados en la escena actual y seleccionar el que corresponda.

<figure id="fig:Registrado2">
[[File:Reg02.png|none|thumb|<caption>fixed and moving volumes</caption>]]
</figure>

La distribución de la pantalla cambia y pasa a ser una rejilla de 3x3 (<xr id="fig:Registrado3" />). Por columnas, se muestran las vistas axial, coronal y sagital en las columnas 1, 2 y 3 (esta es la distribución por defecto, a no ser que el usuario decida modificarlo). Por filas se muestra el ''fixed volume'' en la fila 1, el ''moving volume'' en la fila 2 y el resultado de la superposición de ambos en la fila 3, que pasará a llamarse ''-transformed''.

<figure id="fig:Registrado3">
[[File:Reg03.png|none|thumb|<caption>registration layout</caption>]]
</figure>

===Selección layout===
Si se desea modificar este layout, se hará desde el panel del módulo, modificando las siguientes opciones (<xr id="fig:Registrado4" />). Si no fuera relevante alguna de las vistas se puede desactivar y así no ocupa espacio en pantalla, controlar la transparencia de la superposición de imágenes e incluso el zoom:

Translations:Registrado/17/pt
<figure id="fig:Registrado4">
[[File:Reg04.png|none|thumb|<caption>layout</caption>]]
</figure>

También, si se desea cambiar los volúmenes con los que se esté trabajando, un poco más arriba en el panel del módulo, utilizando el botón '''Select Volumes to Register''' se vuelve al menú de selección descrito en <xr id="fig:Registrado2" />.

Por exemplo, seleccionando ''Coronal'' o layout fica assim (<xr id="fig:Registrado5" />):

<figure id="fig:Registrado5">
[[File:Reg05.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

===Landmarks===
Los puntos de cotejamiento, o landmarks, se añaden en el apartado ''Landmarks'' del panel del módulo, situado justo debajo de los descritos anteriormente (<xr id="fig:Registrado6" />).

<figure id="fig:Registrado6">
[[File:Reg06.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

Se pulsa el botón ADD y se sitúa el punto (el cursor cambia automáticamente y pasamos a estar en modo fiducials) en el ''fixed volume'' haciendo click en el lugar deseado. El programa situará automáticamente ese mismo punto (llamado L-0 en la imagen de ejemplo) en el ''moving volume''. Lo ideal es que estos puntos se coloquen en elementos representativos de ambas imágenes y que sean fácilmente identificables.

Ahora, tal y como se ve en la imagen (<xr id="fig:Registrado7" />), el usuario ha puesto el punto en la vista de la primera columna (verde) y Slicer ha puesto el punto en la vista de la segunda columna (amarilla). El landmark de la ''moving volume'' no está en el mismo lugar que el de la imagen de la ''fixed volume'' (Slicer simplemente lo sitúa en las mismas coordenadas, sin tener en cuenta la imagen y lo que en ella se representa), así que para corregir su localización se hace click en el botón REFINE LANDMARK que está justo debajo de la lista de landmarks presentes en el registrado actual. Entonces podremos desplazar manualmente, pinchando y arrastrando, el landmark del ''moving volume'' hasta la posición que consideremos visualmente correcta.

<figure id="fig:Registrado7">
[[File:Reg07.png|none|thumb|<caption>landmak point</caption>]]
</figure>

Se continúa añadiendo landmarks hasta considerar que se han puesto los necesarios para el ajuste correcto de ambas imágenes, en este punto del proceso de trabajo dispondremos de un conjunto de puntos (<xr id="fig:Registrado8" />), que vienen definidos por su nombre. Se pueden seleccionar haciendo click en el cursor con el icono del ''crosshair'' y eliminarse con el icono de la papelera.

<figure id="fig:Registrado8">
[[File:Reg08.png|none|thumb|<caption>landmak list</caption>]]
</figure>

El refinado de los landmarks puede apoyarse en dos métodos de refinamiento, BRAINSFit y SimpleITK, pero ninguno de estos métodos suple al operador y a su criterio.

===Registration===

No existe un canon que determine el método de registrado a aplicar, puesto que depende de diferentes factores en cada caso, como pueden ser el tipo de imágenes con las que se trabaje, la calidad de las mismas, la anatomía que se esté visualizando y los resultados esperados. Un método estándard y bastante abierto a configuración por parte del usuario es el de la '''Affine Registration'' (<xr id="fig:Registrado9" />), que permite estos tres niveles de ajuste:
*Rigid: permite traslaciones y rotaciones
*Similarity: rigid + cambios de escala uniforme
*Affine: Similarity + deformación
La transformación afín se denomina también transformación lineal y viene definida por diferentes matrices para pasar de un conjunto de coordenadas iniciales a otras [[https://en.wikipedia.org/wiki/Affine_transformation| Wikpedia Affine Transformation]].

<figure id="fig:Registrado9">
[[File:Reg09.png|none|thumb|<caption>linear registration</caption>]]
</figure>

Dependiendo de la calidad y cantidad de landmarks seleccionados el registrado será más o menos exacto y es tarea del operador ir refinando los landmarks para que el resultado sea lo más óptimo posible.

<hr>
[[Clínicos 3D Slicer/pt| MENU]]

Translations:Registrado/31/pt

2018-09-27T18:23:49Z

Artemisa: Página creada con «<figure id="fig:Registrado9"> <caption>linear registration</caption> </figure>»

<figure id="fig:Registrado9">
[[File:Reg09.png|none|thumb|<caption>linear registration</caption>]]
</figure>

Translations:Registrado/29/pt

2018-09-27T18:23:37Z

Artemisa: Página creada con «===Registration===»

===Registration===

Registrado/pt

2018-09-27T18:23:37Z

Artemisa: Página creada con «===Registration===»

__NOTOC__ __NOEDITSECTION__
<languages />

==Registado==
O registado é o processo mediante o qual se sobrepõem de forma coincidente duas imagens médicas tomadas em momentos temporários diferentes, correspondentes à mesma parte do corpo e geralmente ao mesmo paciente, a fim de poder comprovar a evolução de uma lesão/doença/operação.

Mediante esta comparação de imagem estudam-se as diferenças entre ambas, mas para que isto seja possível da maneira mais intuitiva possível se tem de conseguir a coincidência por sobreposição o mais exacta possível. Isto tem de se fazer com duas imagens que, além de ter sido tomadas em momentos temporários diferentes, podem provir de equipas diferentes (outro modelo de scanner, por exemplo) e nos que não se pode garantir que a posição na que estava colocado o paciente tem sido exactamente a mesma (variações em orientação e deslocação).

Un resumen de los posibles escenarios de registrado es:
*estructuras anatómicas cuasi coincidentes: dos imágenes en las que las mismas estructuras anatómicas, de tamaño similar, están presentes en ambas.
*variaciones en la talla del paciente: particularmente en el caso de niños, donde el crecimiento natural hace que existan diferencias de tamaño del cuerpo entero.
*estructuras anatómicas con volúmenes diferentes: cuando se va a estudiar la evolución de una masa tumoral que ha ido creciendo con el tiempo, esta ha aumentado de volumen en una de las imágenes (puede ser la más reciente o la más antigua) y puede que haya desplazado a otras estructuras anatómicas u órganos colindantes.
*estructuras anatómicas inexistentes: tras una cirugía (o tratamiento) en la que se ha practicado una extirpación de parte de tejido (órgano, tumor, hueso, etc...) se han de cotejar pares de en las que hay elementos que no existen en una de las imágenes.

===Descrição do procedimento===

En líneas generales el procedimiento a seguir es el de cargar ambas imágenes una junto a la otra, identificar puntos comunes en cada una (los puntos van emparejados, se toma uno en la imagen A y otro en la imagen B. Si ambas imágenes presentan la misma orientación, no será necesario aplicar distorsión alguna para hacerlas coincidir; pero esto no suele ser lo más común. Entonces se ha de seleccionar cual de las dos imágenes con las que se trabaja (A o B) se va a aplicar una distorsión para lograr la coincidencia plena.

A la hora de determinar los puntos comunes en ambas imágenes, puede ser necesario moverse entre las diferentes slices de las tres vistas disponibles para que en la imagen A y B se esté mostrando la misma información anatómica.

===Módulos===

Os módulos de registado podem-se encontrar na metade inferior do desdobrável de módulos (<xr id="fig:Registrado" />), estão agrupados baixo o nome ''Registration'':

<figure id="fig:Registrado">
[[File:Reg01.png|none|thumb|<caption>registration modules</caption>]]
</figure>

Tradicionalmente utilizou-se o registado em imagens cerebrais, daí que vários dos módulos estejam orientados a estes casos específicos.

====Terminología====
* Landmark: puntos representativos de la imagen (seleccionados por el usuario en ambas imágenes) para asegurar la coincidencia
* Fixed volume: imagen que no va a sufrir transformación alguna
* Moving volume: imagen que se va a transformar para hacerla coincidir con la que se ha seleccionado como ''fixed volume''

==Ejemplo: landmark registration==
===Carga de volúmenes===
Una vez cargados los dos juegos de imágenes, se abre el módulo '''Registration\Landmark registration'''. En ese momento el módulo pide al usuario que determine cual va a ser el ''fixed volume'' y el ''moving volume'' (<xr id="fig:Registrado2" />) utilizando los desplegables, al hacer click en cada uno de ellos se puede ver cuales son los volúmenes cargados en la escena actual y seleccionar el que corresponda.

<figure id="fig:Registrado2">
[[File:Reg02.png|none|thumb|<caption>fixed and moving volumes</caption>]]
</figure>

La distribución de la pantalla cambia y pasa a ser una rejilla de 3x3 (<xr id="fig:Registrado3" />). Por columnas, se muestran las vistas axial, coronal y sagital en las columnas 1, 2 y 3 (esta es la distribución por defecto, a no ser que el usuario decida modificarlo). Por filas se muestra el ''fixed volume'' en la fila 1, el ''moving volume'' en la fila 2 y el resultado de la superposición de ambos en la fila 3, que pasará a llamarse ''-transformed''.

<figure id="fig:Registrado3">
[[File:Reg03.png|none|thumb|<caption>registration layout</caption>]]
</figure>

===Selección layout===
Si se desea modificar este layout, se hará desde el panel del módulo, modificando las siguientes opciones (<xr id="fig:Registrado4" />). Si no fuera relevante alguna de las vistas se puede desactivar y así no ocupa espacio en pantalla, controlar la transparencia de la superposición de imágenes e incluso el zoom:

Translations:Registrado/17/pt
<figure id="fig:Registrado4">
[[File:Reg04.png|none|thumb|<caption>layout</caption>]]
</figure>

También, si se desea cambiar los volúmenes con los que se esté trabajando, un poco más arriba en el panel del módulo, utilizando el botón '''Select Volumes to Register''' se vuelve al menú de selección descrito en <xr id="fig:Registrado2" />.

Por exemplo, seleccionando ''Coronal'' o layout fica assim (<xr id="fig:Registrado5" />):

<figure id="fig:Registrado5">
[[File:Reg05.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

===Landmarks===
Los puntos de cotejamiento, o landmarks, se añaden en el apartado ''Landmarks'' del panel del módulo, situado justo debajo de los descritos anteriormente (<xr id="fig:Registrado6" />).

<figure id="fig:Registrado6">
[[File:Reg06.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

Se pulsa el botón ADD y se sitúa el punto (el cursor cambia automáticamente y pasamos a estar en modo fiducials) en el ''fixed volume'' haciendo click en el lugar deseado. El programa situará automáticamente ese mismo punto (llamado L-0 en la imagen de ejemplo) en el ''moving volume''. Lo ideal es que estos puntos se coloquen en elementos representativos de ambas imágenes y que sean fácilmente identificables.

Ahora, tal y como se ve en la imagen (<xr id="fig:Registrado7" />), el usuario ha puesto el punto en la vista de la primera columna (verde) y Slicer ha puesto el punto en la vista de la segunda columna (amarilla). El landmark de la ''moving volume'' no está en el mismo lugar que el de la imagen de la ''fixed volume'' (Slicer simplemente lo sitúa en las mismas coordenadas, sin tener en cuenta la imagen y lo que en ella se representa), así que para corregir su localización se hace click en el botón REFINE LANDMARK que está justo debajo de la lista de landmarks presentes en el registrado actual. Entonces podremos desplazar manualmente, pinchando y arrastrando, el landmark del ''moving volume'' hasta la posición que consideremos visualmente correcta.

<figure id="fig:Registrado7">
[[File:Reg07.png|none|thumb|<caption>landmak point</caption>]]
</figure>

Se continúa añadiendo landmarks hasta considerar que se han puesto los necesarios para el ajuste correcto de ambas imágenes, en este punto del proceso de trabajo dispondremos de un conjunto de puntos (<xr id="fig:Registrado8" />), que vienen definidos por su nombre. Se pueden seleccionar haciendo click en el cursor con el icono del ''crosshair'' y eliminarse con el icono de la papelera.

<figure id="fig:Registrado8">
[[File:Reg08.png|none|thumb|<caption>landmak list</caption>]]
</figure>

El refinado de los landmarks puede apoyarse en dos métodos de refinamiento, BRAINSFit y SimpleITK, pero ninguno de estos métodos suple al operador y a su criterio.

===Registration===

No existe un canon que determine el método de registrado a aplicar, puesto que depende de diferentes factores en cada caso, como pueden ser el tipo de imágenes con las que se trabaje, la calidad de las mismas, la anatomía que se esté visualizando y los resultados esperados. Un método estándard y bastante abierto a configuración por parte del usuario es el de la '''Affine Registration'' (<xr id="fig:Registrado9" />), que permite estos tres niveles de ajuste:
*Rigid: permite traslaciones y rotaciones
*Similarity: rigid + cambios de escala uniforme
*Affine: Similarity + deformación
La transformación afín se denomina también transformación lineal y viene definida por diferentes matrices para pasar de un conjunto de coordenadas iniciales a otras [[https://en.wikipedia.org/wiki/Affine_transformation| Wikpedia Affine Transformation]].

<figure id="fig:Registrado9">
[[File:Reg09.png|none|thumb|<caption>linear registration</caption>]]
</figure>

Dependiendo de la calidad y cantidad de landmarks seleccionados el registrado será más o menos exacto y es tarea del operador ir refinando los landmarks para que el resultado sea lo más óptimo posible.

<hr>
[[Clínicos 3D Slicer| MENU]]

Translations:Registrado/27/pt

2018-09-27T18:23:23Z

Artemisa: Página creada con «<figure id="fig:Registrado8"> <caption>landmak list</caption> </figure>»

<figure id="fig:Registrado8">
[[File:Reg08.png|none|thumb|<caption>landmak list</caption>]]
</figure>

Translations:Registrado/25/pt

2018-09-27T18:23:12Z

Artemisa: Página creada con «<figure id="fig:Registrado7"> <caption>landmak point</caption> </figure>»

<figure id="fig:Registrado7">
[[File:Reg07.png|none|thumb|<caption>landmak point</caption>]]
</figure>

Translations:Registrado/22/pt

2018-09-27T18:23:03Z

Artemisa: Página creada con «<figure id="fig:Registrado6"> <caption>coronal layout</caption> </figure>»

<figure id="fig:Registrado6">
[[File:Reg06.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

Translations:Registrado/20/pt

2018-09-27T18:22:54Z

Artemisa: Página creada con «<figure id="fig:Registrado5"> <caption>coronal layout</caption> </figure>»

<figure id="fig:Registrado5">
[[File:Reg05.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

Translations:Registrado/19/pt

2018-09-27T18:22:44Z

Artemisa: Página creada con «Por exemplo, seleccionando ''Coronal'' o layout fica assim (<xr id="fig:Registrado5" />):»

Por exemplo, seleccionando ''Coronal'' o layout fica assim (<xr id="fig:Registrado5" />):

Registrado/pt

2018-09-27T18:22:44Z

Artemisa: Página creada con «Por exemplo, seleccionando ''Coronal'' o layout fica assim (<xr id="fig:Registrado5" />):»

__NOTOC__ __NOEDITSECTION__
<languages />

==Registado==
O registado é o processo mediante o qual se sobrepõem de forma coincidente duas imagens médicas tomadas em momentos temporários diferentes, correspondentes à mesma parte do corpo e geralmente ao mesmo paciente, a fim de poder comprovar a evolução de uma lesão/doença/operação.

Mediante esta comparação de imagem estudam-se as diferenças entre ambas, mas para que isto seja possível da maneira mais intuitiva possível se tem de conseguir a coincidência por sobreposição o mais exacta possível. Isto tem de se fazer com duas imagens que, além de ter sido tomadas em momentos temporários diferentes, podem provir de equipas diferentes (outro modelo de scanner, por exemplo) e nos que não se pode garantir que a posição na que estava colocado o paciente tem sido exactamente a mesma (variações em orientação e deslocação).

Un resumen de los posibles escenarios de registrado es:
*estructuras anatómicas cuasi coincidentes: dos imágenes en las que las mismas estructuras anatómicas, de tamaño similar, están presentes en ambas.
*variaciones en la talla del paciente: particularmente en el caso de niños, donde el crecimiento natural hace que existan diferencias de tamaño del cuerpo entero.
*estructuras anatómicas con volúmenes diferentes: cuando se va a estudiar la evolución de una masa tumoral que ha ido creciendo con el tiempo, esta ha aumentado de volumen en una de las imágenes (puede ser la más reciente o la más antigua) y puede que haya desplazado a otras estructuras anatómicas u órganos colindantes.
*estructuras anatómicas inexistentes: tras una cirugía (o tratamiento) en la que se ha practicado una extirpación de parte de tejido (órgano, tumor, hueso, etc...) se han de cotejar pares de en las que hay elementos que no existen en una de las imágenes.

===Descrição do procedimento===

En líneas generales el procedimiento a seguir es el de cargar ambas imágenes una junto a la otra, identificar puntos comunes en cada una (los puntos van emparejados, se toma uno en la imagen A y otro en la imagen B. Si ambas imágenes presentan la misma orientación, no será necesario aplicar distorsión alguna para hacerlas coincidir; pero esto no suele ser lo más común. Entonces se ha de seleccionar cual de las dos imágenes con las que se trabaja (A o B) se va a aplicar una distorsión para lograr la coincidencia plena.

A la hora de determinar los puntos comunes en ambas imágenes, puede ser necesario moverse entre las diferentes slices de las tres vistas disponibles para que en la imagen A y B se esté mostrando la misma información anatómica.

===Módulos===

Os módulos de registado podem-se encontrar na metade inferior do desdobrável de módulos (<xr id="fig:Registrado" />), estão agrupados baixo o nome ''Registration'':

<figure id="fig:Registrado">
[[File:Reg01.png|none|thumb|<caption>registration modules</caption>]]
</figure>

Tradicionalmente utilizou-se o registado em imagens cerebrais, daí que vários dos módulos estejam orientados a estes casos específicos.

====Terminología====
* Landmark: puntos representativos de la imagen (seleccionados por el usuario en ambas imágenes) para asegurar la coincidencia
* Fixed volume: imagen que no va a sufrir transformación alguna
* Moving volume: imagen que se va a transformar para hacerla coincidir con la que se ha seleccionado como ''fixed volume''

==Ejemplo: landmark registration==
===Carga de volúmenes===
Una vez cargados los dos juegos de imágenes, se abre el módulo '''Registration\Landmark registration'''. En ese momento el módulo pide al usuario que determine cual va a ser el ''fixed volume'' y el ''moving volume'' (<xr id="fig:Registrado2" />) utilizando los desplegables, al hacer click en cada uno de ellos se puede ver cuales son los volúmenes cargados en la escena actual y seleccionar el que corresponda.

<figure id="fig:Registrado2">
[[File:Reg02.png|none|thumb|<caption>fixed and moving volumes</caption>]]
</figure>

La distribución de la pantalla cambia y pasa a ser una rejilla de 3x3 (<xr id="fig:Registrado3" />). Por columnas, se muestran las vistas axial, coronal y sagital en las columnas 1, 2 y 3 (esta es la distribución por defecto, a no ser que el usuario decida modificarlo). Por filas se muestra el ''fixed volume'' en la fila 1, el ''moving volume'' en la fila 2 y el resultado de la superposición de ambos en la fila 3, que pasará a llamarse ''-transformed''.

<figure id="fig:Registrado3">
[[File:Reg03.png|none|thumb|<caption>registration layout</caption>]]
</figure>

===Selección layout===
Si se desea modificar este layout, se hará desde el panel del módulo, modificando las siguientes opciones (<xr id="fig:Registrado4" />). Si no fuera relevante alguna de las vistas se puede desactivar y así no ocupa espacio en pantalla, controlar la transparencia de la superposición de imágenes e incluso el zoom:

Translations:Registrado/17/pt
<figure id="fig:Registrado4">
[[File:Reg04.png|none|thumb|<caption>layout</caption>]]
</figure>

También, si se desea cambiar los volúmenes con los que se esté trabajando, un poco más arriba en el panel del módulo, utilizando el botón '''Select Volumes to Register''' se vuelve al menú de selección descrito en <xr id="fig:Registrado2" />.

Por exemplo, seleccionando ''Coronal'' o layout fica assim (<xr id="fig:Registrado5" />):

<figure id="fig:Registrado5">
[[File:Reg05.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

===Landmarks===
Los puntos de cotejamiento, o landmarks, se añaden en el apartado ''Landmarks'' del panel del módulo, situado justo debajo de los descritos anteriormente (<xr id="fig:Registrado6" />).

<figure id="fig:Registrado6">
[[File:Reg06.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

Se pulsa el botón ADD y se sitúa el punto (el cursor cambia automáticamente y pasamos a estar en modo fiducials) en el ''fixed volume'' haciendo click en el lugar deseado. El programa situará automáticamente ese mismo punto (llamado L-0 en la imagen de ejemplo) en el ''moving volume''. Lo ideal es que estos puntos se coloquen en elementos representativos de ambas imágenes y que sean fácilmente identificables.

Ahora, tal y como se ve en la imagen (<xr id="fig:Registrado7" />), el usuario ha puesto el punto en la vista de la primera columna (verde) y Slicer ha puesto el punto en la vista de la segunda columna (amarilla). El landmark de la ''moving volume'' no está en el mismo lugar que el de la imagen de la ''fixed volume'' (Slicer simplemente lo sitúa en las mismas coordenadas, sin tener en cuenta la imagen y lo que en ella se representa), así que para corregir su localización se hace click en el botón REFINE LANDMARK que está justo debajo de la lista de landmarks presentes en el registrado actual. Entonces podremos desplazar manualmente, pinchando y arrastrando, el landmark del ''moving volume'' hasta la posición que consideremos visualmente correcta.

<figure id="fig:Registrado7">
[[File:Reg07.png|none|thumb|<caption>landmak point</caption>]]
</figure>

Se continúa añadiendo landmarks hasta considerar que se han puesto los necesarios para el ajuste correcto de ambas imágenes, en este punto del proceso de trabajo dispondremos de un conjunto de puntos (<xr id="fig:Registrado8" />), que vienen definidos por su nombre. Se pueden seleccionar haciendo click en el cursor con el icono del ''crosshair'' y eliminarse con el icono de la papelera.

<figure id="fig:Registrado8">
[[File:Reg08.png|none|thumb|<caption>landmak list</caption>]]
</figure>

El refinado de los landmarks puede apoyarse en dos métodos de refinamiento, BRAINSFit y SimpleITK, pero ninguno de estos métodos suple al operador y a su criterio.

===Registrado===

No existe un canon que determine el método de registrado a aplicar, puesto que depende de diferentes factores en cada caso, como pueden ser el tipo de imágenes con las que se trabaje, la calidad de las mismas, la anatomía que se esté visualizando y los resultados esperados. Un método estándard y bastante abierto a configuración por parte del usuario es el de la '''Affine Registration'' (<xr id="fig:Registrado9" />), que permite estos tres niveles de ajuste:
*Rigid: permite traslaciones y rotaciones
*Similarity: rigid + cambios de escala uniforme
*Affine: Similarity + deformación
La transformación afín se denomina también transformación lineal y viene definida por diferentes matrices para pasar de un conjunto de coordenadas iniciales a otras [[https://en.wikipedia.org/wiki/Affine_transformation| Wikpedia Affine Transformation]].

<figure id="fig:Registrado9">
[[File:Reg09.png|none|thumb|<caption>linear registration</caption>]]
</figure>

Dependiendo de la calidad y cantidad de landmarks seleccionados el registrado será más o menos exacto y es tarea del operador ir refinando los landmarks para que el resultado sea lo más óptimo posible.

<hr>
[[Clínicos 3D Slicer| MENU]]

Registrado/pt

2018-09-27T18:22:31Z

Artemisa: Página creada con «Translations:Registrado/17/pt <figure id="fig:Registrado4"> <caption>layout</caption> </figure>»

__NOTOC__ __NOEDITSECTION__
<languages />

==Registado==
O registado é o processo mediante o qual se sobrepõem de forma coincidente duas imagens médicas tomadas em momentos temporários diferentes, correspondentes à mesma parte do corpo e geralmente ao mesmo paciente, a fim de poder comprovar a evolução de uma lesão/doença/operação.

Mediante esta comparação de imagem estudam-se as diferenças entre ambas, mas para que isto seja possível da maneira mais intuitiva possível se tem de conseguir a coincidência por sobreposição o mais exacta possível. Isto tem de se fazer com duas imagens que, além de ter sido tomadas em momentos temporários diferentes, podem provir de equipas diferentes (outro modelo de scanner, por exemplo) e nos que não se pode garantir que a posição na que estava colocado o paciente tem sido exactamente a mesma (variações em orientação e deslocação).

Un resumen de los posibles escenarios de registrado es:
*estructuras anatómicas cuasi coincidentes: dos imágenes en las que las mismas estructuras anatómicas, de tamaño similar, están presentes en ambas.
*variaciones en la talla del paciente: particularmente en el caso de niños, donde el crecimiento natural hace que existan diferencias de tamaño del cuerpo entero.
*estructuras anatómicas con volúmenes diferentes: cuando se va a estudiar la evolución de una masa tumoral que ha ido creciendo con el tiempo, esta ha aumentado de volumen en una de las imágenes (puede ser la más reciente o la más antigua) y puede que haya desplazado a otras estructuras anatómicas u órganos colindantes.
*estructuras anatómicas inexistentes: tras una cirugía (o tratamiento) en la que se ha practicado una extirpación de parte de tejido (órgano, tumor, hueso, etc...) se han de cotejar pares de en las que hay elementos que no existen en una de las imágenes.

===Descrição do procedimento===

En líneas generales el procedimiento a seguir es el de cargar ambas imágenes una junto a la otra, identificar puntos comunes en cada una (los puntos van emparejados, se toma uno en la imagen A y otro en la imagen B. Si ambas imágenes presentan la misma orientación, no será necesario aplicar distorsión alguna para hacerlas coincidir; pero esto no suele ser lo más común. Entonces se ha de seleccionar cual de las dos imágenes con las que se trabaja (A o B) se va a aplicar una distorsión para lograr la coincidencia plena.

A la hora de determinar los puntos comunes en ambas imágenes, puede ser necesario moverse entre las diferentes slices de las tres vistas disponibles para que en la imagen A y B se esté mostrando la misma información anatómica.

===Módulos===

Os módulos de registado podem-se encontrar na metade inferior do desdobrável de módulos (<xr id="fig:Registrado" />), estão agrupados baixo o nome ''Registration'':

<figure id="fig:Registrado">
[[File:Reg01.png|none|thumb|<caption>registration modules</caption>]]
</figure>

Tradicionalmente utilizou-se o registado em imagens cerebrais, daí que vários dos módulos estejam orientados a estes casos específicos.

====Terminología====
* Landmark: puntos representativos de la imagen (seleccionados por el usuario en ambas imágenes) para asegurar la coincidencia
* Fixed volume: imagen que no va a sufrir transformación alguna
* Moving volume: imagen que se va a transformar para hacerla coincidir con la que se ha seleccionado como ''fixed volume''

==Ejemplo: landmark registration==
===Carga de volúmenes===
Una vez cargados los dos juegos de imágenes, se abre el módulo '''Registration\Landmark registration'''. En ese momento el módulo pide al usuario que determine cual va a ser el ''fixed volume'' y el ''moving volume'' (<xr id="fig:Registrado2" />) utilizando los desplegables, al hacer click en cada uno de ellos se puede ver cuales son los volúmenes cargados en la escena actual y seleccionar el que corresponda.

<figure id="fig:Registrado2">
[[File:Reg02.png|none|thumb|<caption>fixed and moving volumes</caption>]]
</figure>

La distribución de la pantalla cambia y pasa a ser una rejilla de 3x3 (<xr id="fig:Registrado3" />). Por columnas, se muestran las vistas axial, coronal y sagital en las columnas 1, 2 y 3 (esta es la distribución por defecto, a no ser que el usuario decida modificarlo). Por filas se muestra el ''fixed volume'' en la fila 1, el ''moving volume'' en la fila 2 y el resultado de la superposición de ambos en la fila 3, que pasará a llamarse ''-transformed''.

<figure id="fig:Registrado3">
[[File:Reg03.png|none|thumb|<caption>registration layout</caption>]]
</figure>

===Selección layout===
Si se desea modificar este layout, se hará desde el panel del módulo, modificando las siguientes opciones (<xr id="fig:Registrado4" />). Si no fuera relevante alguna de las vistas se puede desactivar y así no ocupa espacio en pantalla, controlar la transparencia de la superposición de imágenes e incluso el zoom:

Translations:Registrado/17/pt
<figure id="fig:Registrado4">
[[File:Reg04.png|none|thumb|<caption>layout</caption>]]
</figure>

También, si se desea cambiar los volúmenes con los que se esté trabajando, un poco más arriba en el panel del módulo, utilizando el botón '''Select Volumes to Register''' se vuelve al menú de selección descrito en <xr id="fig:Registrado2" />.

Por ejemplo, seleccionando ''Coronal'' el layout queda así (<xr id="fig:Registrado5" />):

<figure id="fig:Registrado5">
[[File:Reg05.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

===Landmarks===
Los puntos de cotejamiento, o landmarks, se añaden en el apartado ''Landmarks'' del panel del módulo, situado justo debajo de los descritos anteriormente (<xr id="fig:Registrado6" />).

<figure id="fig:Registrado6">
[[File:Reg06.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

Se pulsa el botón ADD y se sitúa el punto (el cursor cambia automáticamente y pasamos a estar en modo fiducials) en el ''fixed volume'' haciendo click en el lugar deseado. El programa situará automáticamente ese mismo punto (llamado L-0 en la imagen de ejemplo) en el ''moving volume''. Lo ideal es que estos puntos se coloquen en elementos representativos de ambas imágenes y que sean fácilmente identificables.

Ahora, tal y como se ve en la imagen (<xr id="fig:Registrado7" />), el usuario ha puesto el punto en la vista de la primera columna (verde) y Slicer ha puesto el punto en la vista de la segunda columna (amarilla). El landmark de la ''moving volume'' no está en el mismo lugar que el de la imagen de la ''fixed volume'' (Slicer simplemente lo sitúa en las mismas coordenadas, sin tener en cuenta la imagen y lo que en ella se representa), así que para corregir su localización se hace click en el botón REFINE LANDMARK que está justo debajo de la lista de landmarks presentes en el registrado actual. Entonces podremos desplazar manualmente, pinchando y arrastrando, el landmark del ''moving volume'' hasta la posición que consideremos visualmente correcta.

<figure id="fig:Registrado7">
[[File:Reg07.png|none|thumb|<caption>landmak point</caption>]]
</figure>

Se continúa añadiendo landmarks hasta considerar que se han puesto los necesarios para el ajuste correcto de ambas imágenes, en este punto del proceso de trabajo dispondremos de un conjunto de puntos (<xr id="fig:Registrado8" />), que vienen definidos por su nombre. Se pueden seleccionar haciendo click en el cursor con el icono del ''crosshair'' y eliminarse con el icono de la papelera.

<figure id="fig:Registrado8">
[[File:Reg08.png|none|thumb|<caption>landmak list</caption>]]
</figure>

El refinado de los landmarks puede apoyarse en dos métodos de refinamiento, BRAINSFit y SimpleITK, pero ninguno de estos métodos suple al operador y a su criterio.

===Registrado===

No existe un canon que determine el método de registrado a aplicar, puesto que depende de diferentes factores en cada caso, como pueden ser el tipo de imágenes con las que se trabaje, la calidad de las mismas, la anatomía que se esté visualizando y los resultados esperados. Un método estándard y bastante abierto a configuración por parte del usuario es el de la '''Affine Registration'' (<xr id="fig:Registrado9" />), que permite estos tres niveles de ajuste:
*Rigid: permite traslaciones y rotaciones
*Similarity: rigid + cambios de escala uniforme
*Affine: Similarity + deformación
La transformación afín se denomina también transformación lineal y viene definida por diferentes matrices para pasar de un conjunto de coordenadas iniciales a otras [[https://en.wikipedia.org/wiki/Affine_transformation| Wikpedia Affine Transformation]].

<figure id="fig:Registrado9">
[[File:Reg09.png|none|thumb|<caption>linear registration</caption>]]
</figure>

Dependiendo de la calidad y cantidad de landmarks seleccionados el registrado será más o menos exacto y es tarea del operador ir refinando los landmarks para que el resultado sea lo más óptimo posible.

<hr>
[[Clínicos 3D Slicer| MENU]]

Translations:Registrado/17/pt

2018-09-27T18:22:30Z

Artemisa: Página creada con «Translations:Registrado/17/pt <figure id="fig:Registrado4"> <caption>layout</caption> </figure>»

Translations:Registrado/17/pt
<figure id="fig:Registrado4">
[[File:Reg04.png|none|thumb|<caption>layout</caption>]]
</figure>

Translations:Registrado/15/pt

2018-09-27T18:22:22Z

Artemisa: Página creada con «<figure id="fig:Registrado3"> <caption>registration layout</caption> </figure>»

<figure id="fig:Registrado3">
[[File:Reg03.png|none|thumb|<caption>registration layout</caption>]]
</figure>

Translations:Registrado/13/pt

2018-09-27T18:22:09Z

Artemisa: Página creada con «<figure id="fig:Registrado2"> <caption>fixed and moving volumes</caption> </figure>»

<figure id="fig:Registrado2">
[[File:Reg02.png|none|thumb|<caption>fixed and moving volumes</caption>]]
</figure>

Registrado/pt

2018-09-27T18:21:55Z

Artemisa: Página creada con «Tradicionalmente utilizou-se o registado em imagens cerebrais, daí que vários dos módulos estejam orientados a estes casos específicos.»

__NOTOC__ __NOEDITSECTION__
<languages />

==Registado==
O registado é o processo mediante o qual se sobrepõem de forma coincidente duas imagens médicas tomadas em momentos temporários diferentes, correspondentes à mesma parte do corpo e geralmente ao mesmo paciente, a fim de poder comprovar a evolução de uma lesão/doença/operação.

Mediante esta comparação de imagem estudam-se as diferenças entre ambas, mas para que isto seja possível da maneira mais intuitiva possível se tem de conseguir a coincidência por sobreposição o mais exacta possível. Isto tem de se fazer com duas imagens que, além de ter sido tomadas em momentos temporários diferentes, podem provir de equipas diferentes (outro modelo de scanner, por exemplo) e nos que não se pode garantir que a posição na que estava colocado o paciente tem sido exactamente a mesma (variações em orientação e deslocação).

Un resumen de los posibles escenarios de registrado es:
*estructuras anatómicas cuasi coincidentes: dos imágenes en las que las mismas estructuras anatómicas, de tamaño similar, están presentes en ambas.
*variaciones en la talla del paciente: particularmente en el caso de niños, donde el crecimiento natural hace que existan diferencias de tamaño del cuerpo entero.
*estructuras anatómicas con volúmenes diferentes: cuando se va a estudiar la evolución de una masa tumoral que ha ido creciendo con el tiempo, esta ha aumentado de volumen en una de las imágenes (puede ser la más reciente o la más antigua) y puede que haya desplazado a otras estructuras anatómicas u órganos colindantes.
*estructuras anatómicas inexistentes: tras una cirugía (o tratamiento) en la que se ha practicado una extirpación de parte de tejido (órgano, tumor, hueso, etc...) se han de cotejar pares de en las que hay elementos que no existen en una de las imágenes.

===Descrição do procedimento===

En líneas generales el procedimiento a seguir es el de cargar ambas imágenes una junto a la otra, identificar puntos comunes en cada una (los puntos van emparejados, se toma uno en la imagen A y otro en la imagen B. Si ambas imágenes presentan la misma orientación, no será necesario aplicar distorsión alguna para hacerlas coincidir; pero esto no suele ser lo más común. Entonces se ha de seleccionar cual de las dos imágenes con las que se trabaja (A o B) se va a aplicar una distorsión para lograr la coincidencia plena.

A la hora de determinar los puntos comunes en ambas imágenes, puede ser necesario moverse entre las diferentes slices de las tres vistas disponibles para que en la imagen A y B se esté mostrando la misma información anatómica.

===Módulos===

Os módulos de registado podem-se encontrar na metade inferior do desdobrável de módulos (<xr id="fig:Registrado" />), estão agrupados baixo o nome ''Registration'':

<figure id="fig:Registrado">
[[File:Reg01.png|none|thumb|<caption>registration modules</caption>]]
</figure>

Tradicionalmente utilizou-se o registado em imagens cerebrais, daí que vários dos módulos estejam orientados a estes casos específicos.

====Terminología====
* Landmark: puntos representativos de la imagen (seleccionados por el usuario en ambas imágenes) para asegurar la coincidencia
* Fixed volume: imagen que no va a sufrir transformación alguna
* Moving volume: imagen que se va a transformar para hacerla coincidir con la que se ha seleccionado como ''fixed volume''

==Ejemplo: landmark registration==
===Carga de volúmenes===
Una vez cargados los dos juegos de imágenes, se abre el módulo '''Registration\Landmark registration'''. En ese momento el módulo pide al usuario que determine cual va a ser el ''fixed volume'' y el ''moving volume'' (<xr id="fig:Registrado2" />) utilizando los desplegables, al hacer click en cada uno de ellos se puede ver cuales son los volúmenes cargados en la escena actual y seleccionar el que corresponda.

<figure id="fig:Registrado2">
[[File:Reg02.png|none|thumb|<caption>fixed and moving volumes</caption>]]
</figure>

La distribución de la pantalla cambia y pasa a ser una rejilla de 3x3 (<xr id="fig:Registrado3" />). Por columnas, se muestran las vistas axial, coronal y sagital en las columnas 1, 2 y 3 (esta es la distribución por defecto, a no ser que el usuario decida modificarlo). Por filas se muestra el ''fixed volume'' en la fila 1, el ''moving volume'' en la fila 2 y el resultado de la superposición de ambos en la fila 3, que pasará a llamarse ''-transformed''.

<figure id="fig:Registrado3">
[[File:Reg03.png|none|thumb|<caption>registration layout</caption>]]
</figure>

===Selección layout===
Si se desea modificar este layout, se hará desde el panel del módulo, modificando las siguientes opciones (<xr id="fig:Registrado4" />). Si no fuera relevante alguna de las vistas se puede desactivar y así no ocupa espacio en pantalla, controlar la transparencia de la superposición de imágenes e incluso el zoom:

<figure id="fig:Registrado4">
[[File:Reg04.png|none|thumb|<caption>layout</caption>]]
</figure>

También, si se desea cambiar los volúmenes con los que se esté trabajando, un poco más arriba en el panel del módulo, utilizando el botón '''Select Volumes to Register''' se vuelve al menú de selección descrito en <xr id="fig:Registrado2" />.

Por ejemplo, seleccionando ''Coronal'' el layout queda así (<xr id="fig:Registrado5" />):

<figure id="fig:Registrado5">
[[File:Reg05.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

===Landmarks===
Los puntos de cotejamiento, o landmarks, se añaden en el apartado ''Landmarks'' del panel del módulo, situado justo debajo de los descritos anteriormente (<xr id="fig:Registrado6" />).

<figure id="fig:Registrado6">
[[File:Reg06.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

Se pulsa el botón ADD y se sitúa el punto (el cursor cambia automáticamente y pasamos a estar en modo fiducials) en el ''fixed volume'' haciendo click en el lugar deseado. El programa situará automáticamente ese mismo punto (llamado L-0 en la imagen de ejemplo) en el ''moving volume''. Lo ideal es que estos puntos se coloquen en elementos representativos de ambas imágenes y que sean fácilmente identificables.

Ahora, tal y como se ve en la imagen (<xr id="fig:Registrado7" />), el usuario ha puesto el punto en la vista de la primera columna (verde) y Slicer ha puesto el punto en la vista de la segunda columna (amarilla). El landmark de la ''moving volume'' no está en el mismo lugar que el de la imagen de la ''fixed volume'' (Slicer simplemente lo sitúa en las mismas coordenadas, sin tener en cuenta la imagen y lo que en ella se representa), así que para corregir su localización se hace click en el botón REFINE LANDMARK que está justo debajo de la lista de landmarks presentes en el registrado actual. Entonces podremos desplazar manualmente, pinchando y arrastrando, el landmark del ''moving volume'' hasta la posición que consideremos visualmente correcta.

<figure id="fig:Registrado7">
[[File:Reg07.png|none|thumb|<caption>landmak point</caption>]]
</figure>

Se continúa añadiendo landmarks hasta considerar que se han puesto los necesarios para el ajuste correcto de ambas imágenes, en este punto del proceso de trabajo dispondremos de un conjunto de puntos (<xr id="fig:Registrado8" />), que vienen definidos por su nombre. Se pueden seleccionar haciendo click en el cursor con el icono del ''crosshair'' y eliminarse con el icono de la papelera.

<figure id="fig:Registrado8">
[[File:Reg08.png|none|thumb|<caption>landmak list</caption>]]
</figure>

El refinado de los landmarks puede apoyarse en dos métodos de refinamiento, BRAINSFit y SimpleITK, pero ninguno de estos métodos suple al operador y a su criterio.

===Registrado===

No existe un canon que determine el método de registrado a aplicar, puesto que depende de diferentes factores en cada caso, como pueden ser el tipo de imágenes con las que se trabaje, la calidad de las mismas, la anatomía que se esté visualizando y los resultados esperados. Un método estándard y bastante abierto a configuración por parte del usuario es el de la '''Affine Registration'' (<xr id="fig:Registrado9" />), que permite estos tres niveles de ajuste:
*Rigid: permite traslaciones y rotaciones
*Similarity: rigid + cambios de escala uniforme
*Affine: Similarity + deformación
La transformación afín se denomina también transformación lineal y viene definida por diferentes matrices para pasar de un conjunto de coordenadas iniciales a otras [[https://en.wikipedia.org/wiki/Affine_transformation| Wikpedia Affine Transformation]].

<figure id="fig:Registrado9">
[[File:Reg09.png|none|thumb|<caption>linear registration</caption>]]
</figure>

Dependiendo de la calidad y cantidad de landmarks seleccionados el registrado será más o menos exacto y es tarea del operador ir refinando los landmarks para que el resultado sea lo más óptimo posible.

<hr>
[[Clínicos 3D Slicer| MENU]]

Translations:Registrado/10/pt

2018-09-27T18:21:54Z

Artemisa: Página creada con «Tradicionalmente utilizou-se o registado em imagens cerebrais, daí que vários dos módulos estejam orientados a estes casos específicos.»

Tradicionalmente utilizou-se o registado em imagens cerebrais, daí que vários dos módulos estejam orientados a estes casos específicos.

Translations:Registrado/9/pt

2018-09-27T18:21:45Z

Artemisa: Página creada con «<figure id="fig:Registrado"> <caption>registration modules</caption> </figure>»

<figure id="fig:Registrado">
[[File:Reg01.png|none|thumb|<caption>registration modules</caption>]]
</figure>

Translations:Registrado/8/pt

2018-09-27T18:21:28Z

Artemisa: Página creada con «Os módulos de registado podem-se encontrar na metade inferior do desdobrável de módulos (<xr id="fig:Registrado" />), estão agrupados baixo o nome ''Registration'':»

Os módulos de registado podem-se encontrar na metade inferior do desdobrável de módulos (<xr id="fig:Registrado" />), estão agrupados baixo o nome ''Registration'':

Registrado/pt

2018-09-27T18:21:28Z

__NOTOC__ __NOEDITSECTION__
<languages />

==Registado==
O registado é o processo mediante o qual se sobrepõem de forma coincidente duas imagens médicas tomadas em momentos temporários diferentes, correspondentes à mesma parte do corpo e geralmente ao mesmo paciente, a fim de poder comprovar a evolução de uma lesão/doença/operação.

Mediante esta comparação de imagem estudam-se as diferenças entre ambas, mas para que isto seja possível da maneira mais intuitiva possível se tem de conseguir a coincidência por sobreposição o mais exacta possível. Isto tem de se fazer com duas imagens que, além de ter sido tomadas em momentos temporários diferentes, podem provir de equipas diferentes (outro modelo de scanner, por exemplo) e nos que não se pode garantir que a posição na que estava colocado o paciente tem sido exactamente a mesma (variações em orientação e deslocação).

Un resumen de los posibles escenarios de registrado es:
*estructuras anatómicas cuasi coincidentes: dos imágenes en las que las mismas estructuras anatómicas, de tamaño similar, están presentes en ambas.
*variaciones en la talla del paciente: particularmente en el caso de niños, donde el crecimiento natural hace que existan diferencias de tamaño del cuerpo entero.
*estructuras anatómicas con volúmenes diferentes: cuando se va a estudiar la evolución de una masa tumoral que ha ido creciendo con el tiempo, esta ha aumentado de volumen en una de las imágenes (puede ser la más reciente o la más antigua) y puede que haya desplazado a otras estructuras anatómicas u órganos colindantes.
*estructuras anatómicas inexistentes: tras una cirugía (o tratamiento) en la que se ha practicado una extirpación de parte de tejido (órgano, tumor, hueso, etc...) se han de cotejar pares de en las que hay elementos que no existen en una de las imágenes.

===Descrição do procedimento===

En líneas generales el procedimiento a seguir es el de cargar ambas imágenes una junto a la otra, identificar puntos comunes en cada una (los puntos van emparejados, se toma uno en la imagen A y otro en la imagen B. Si ambas imágenes presentan la misma orientación, no será necesario aplicar distorsión alguna para hacerlas coincidir; pero esto no suele ser lo más común. Entonces se ha de seleccionar cual de las dos imágenes con las que se trabaja (A o B) se va a aplicar una distorsión para lograr la coincidencia plena.

A la hora de determinar los puntos comunes en ambas imágenes, puede ser necesario moverse entre las diferentes slices de las tres vistas disponibles para que en la imagen A y B se esté mostrando la misma información anatómica.

===Módulos===

Os módulos de registado podem-se encontrar na metade inferior do desdobrável de módulos (<xr id="fig:Registrado" />), estão agrupados baixo o nome ''Registration'':

<figure id="fig:Registrado">
[[File:Reg01.png|none|thumb|<caption>registration modules</caption>]]
</figure>

Tradicionalmente se ha utilizado el registrado en imágenes cerebrales, de ahí que varios de los módulos estén orientados a estos casos específicos.

====Terminología====
* Landmark: puntos representativos de la imagen (seleccionados por el usuario en ambas imágenes) para asegurar la coincidencia
* Fixed volume: imagen que no va a sufrir transformación alguna
* Moving volume: imagen que se va a transformar para hacerla coincidir con la que se ha seleccionado como ''fixed volume''

==Ejemplo: landmark registration==
===Carga de volúmenes===
Una vez cargados los dos juegos de imágenes, se abre el módulo '''Registration\Landmark registration'''. En ese momento el módulo pide al usuario que determine cual va a ser el ''fixed volume'' y el ''moving volume'' (<xr id="fig:Registrado2" />) utilizando los desplegables, al hacer click en cada uno de ellos se puede ver cuales son los volúmenes cargados en la escena actual y seleccionar el que corresponda.

<figure id="fig:Registrado2">
[[File:Reg02.png|none|thumb|<caption>fixed and moving volumes</caption>]]
</figure>

La distribución de la pantalla cambia y pasa a ser una rejilla de 3x3 (<xr id="fig:Registrado3" />). Por columnas, se muestran las vistas axial, coronal y sagital en las columnas 1, 2 y 3 (esta es la distribución por defecto, a no ser que el usuario decida modificarlo). Por filas se muestra el ''fixed volume'' en la fila 1, el ''moving volume'' en la fila 2 y el resultado de la superposición de ambos en la fila 3, que pasará a llamarse ''-transformed''.

<figure id="fig:Registrado3">
[[File:Reg03.png|none|thumb|<caption>registration layout</caption>]]
</figure>

===Selección layout===
Si se desea modificar este layout, se hará desde el panel del módulo, modificando las siguientes opciones (<xr id="fig:Registrado4" />). Si no fuera relevante alguna de las vistas se puede desactivar y así no ocupa espacio en pantalla, controlar la transparencia de la superposición de imágenes e incluso el zoom:

<figure id="fig:Registrado4">
[[File:Reg04.png|none|thumb|<caption>layout</caption>]]
</figure>

También, si se desea cambiar los volúmenes con los que se esté trabajando, un poco más arriba en el panel del módulo, utilizando el botón '''Select Volumes to Register''' se vuelve al menú de selección descrito en <xr id="fig:Registrado2" />.

Por ejemplo, seleccionando ''Coronal'' el layout queda así (<xr id="fig:Registrado5" />):

<figure id="fig:Registrado5">
[[File:Reg05.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

===Landmarks===
Los puntos de cotejamiento, o landmarks, se añaden en el apartado ''Landmarks'' del panel del módulo, situado justo debajo de los descritos anteriormente (<xr id="fig:Registrado6" />).

<figure id="fig:Registrado6">
[[File:Reg06.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

Se pulsa el botón ADD y se sitúa el punto (el cursor cambia automáticamente y pasamos a estar en modo fiducials) en el ''fixed volume'' haciendo click en el lugar deseado. El programa situará automáticamente ese mismo punto (llamado L-0 en la imagen de ejemplo) en el ''moving volume''. Lo ideal es que estos puntos se coloquen en elementos representativos de ambas imágenes y que sean fácilmente identificables.

Ahora, tal y como se ve en la imagen (<xr id="fig:Registrado7" />), el usuario ha puesto el punto en la vista de la primera columna (verde) y Slicer ha puesto el punto en la vista de la segunda columna (amarilla). El landmark de la ''moving volume'' no está en el mismo lugar que el de la imagen de la ''fixed volume'' (Slicer simplemente lo sitúa en las mismas coordenadas, sin tener en cuenta la imagen y lo que en ella se representa), así que para corregir su localización se hace click en el botón REFINE LANDMARK que está justo debajo de la lista de landmarks presentes en el registrado actual. Entonces podremos desplazar manualmente, pinchando y arrastrando, el landmark del ''moving volume'' hasta la posición que consideremos visualmente correcta.

<figure id="fig:Registrado7">
[[File:Reg07.png|none|thumb|<caption>landmak point</caption>]]
</figure>

Se continúa añadiendo landmarks hasta considerar que se han puesto los necesarios para el ajuste correcto de ambas imágenes, en este punto del proceso de trabajo dispondremos de un conjunto de puntos (<xr id="fig:Registrado8" />), que vienen definidos por su nombre. Se pueden seleccionar haciendo click en el cursor con el icono del ''crosshair'' y eliminarse con el icono de la papelera.

<figure id="fig:Registrado8">
[[File:Reg08.png|none|thumb|<caption>landmak list</caption>]]
</figure>

El refinado de los landmarks puede apoyarse en dos métodos de refinamiento, BRAINSFit y SimpleITK, pero ninguno de estos métodos suple al operador y a su criterio.

===Registrado===

No existe un canon que determine el método de registrado a aplicar, puesto que depende de diferentes factores en cada caso, como pueden ser el tipo de imágenes con las que se trabaje, la calidad de las mismas, la anatomía que se esté visualizando y los resultados esperados. Un método estándard y bastante abierto a configuración por parte del usuario es el de la '''Affine Registration'' (<xr id="fig:Registrado9" />), que permite estos tres niveles de ajuste:
*Rigid: permite traslaciones y rotaciones
*Similarity: rigid + cambios de escala uniforme
*Affine: Similarity + deformación
La transformación afín se denomina también transformación lineal y viene definida por diferentes matrices para pasar de un conjunto de coordenadas iniciales a otras [[https://en.wikipedia.org/wiki/Affine_transformation| Wikpedia Affine Transformation]].

<figure id="fig:Registrado9">
[[File:Reg09.png|none|thumb|<caption>linear registration</caption>]]
</figure>

Dependiendo de la calidad y cantidad de landmarks seleccionados el registrado será más o menos exacto y es tarea del operador ir refinando los landmarks para que el resultado sea lo más óptimo posible.

<hr>
[[Clínicos 3D Slicer| MENU]]

Translations:Registrado/7/pt

2018-09-27T18:21:17Z

Artemisa: Página creada con «===Módulos===»

===Módulos===

Translations:Registrado/5/pt

2018-09-27T18:21:09Z

Artemisa: Página creada con «===Descrição do procedimento===»

===Descrição do procedimento===

Registrado/pt

2018-09-27T18:21:09Z

Artemisa: Página creada con «===Descrição do procedimento===»

__NOTOC__ __NOEDITSECTION__
<languages />

==Registado==
O registado é o processo mediante o qual se sobrepõem de forma coincidente duas imagens médicas tomadas em momentos temporários diferentes, correspondentes à mesma parte do corpo e geralmente ao mesmo paciente, a fim de poder comprovar a evolução de uma lesão/doença/operação.

Mediante esta comparação de imagem estudam-se as diferenças entre ambas, mas para que isto seja possível da maneira mais intuitiva possível se tem de conseguir a coincidência por sobreposição o mais exacta possível. Isto tem de se fazer com duas imagens que, além de ter sido tomadas em momentos temporários diferentes, podem provir de equipas diferentes (outro modelo de scanner, por exemplo) e nos que não se pode garantir que a posição na que estava colocado o paciente tem sido exactamente a mesma (variações em orientação e deslocação).

Un resumen de los posibles escenarios de registrado es:
*estructuras anatómicas cuasi coincidentes: dos imágenes en las que las mismas estructuras anatómicas, de tamaño similar, están presentes en ambas.
*variaciones en la talla del paciente: particularmente en el caso de niños, donde el crecimiento natural hace que existan diferencias de tamaño del cuerpo entero.
*estructuras anatómicas con volúmenes diferentes: cuando se va a estudiar la evolución de una masa tumoral que ha ido creciendo con el tiempo, esta ha aumentado de volumen en una de las imágenes (puede ser la más reciente o la más antigua) y puede que haya desplazado a otras estructuras anatómicas u órganos colindantes.
*estructuras anatómicas inexistentes: tras una cirugía (o tratamiento) en la que se ha practicado una extirpación de parte de tejido (órgano, tumor, hueso, etc...) se han de cotejar pares de en las que hay elementos que no existen en una de las imágenes.

===Descrição do procedimento===

En líneas generales el procedimiento a seguir es el de cargar ambas imágenes una junto a la otra, identificar puntos comunes en cada una (los puntos van emparejados, se toma uno en la imagen A y otro en la imagen B. Si ambas imágenes presentan la misma orientación, no será necesario aplicar distorsión alguna para hacerlas coincidir; pero esto no suele ser lo más común. Entonces se ha de seleccionar cual de las dos imágenes con las que se trabaja (A o B) se va a aplicar una distorsión para lograr la coincidencia plena.

A la hora de determinar los puntos comunes en ambas imágenes, puede ser necesario moverse entre las diferentes slices de las tres vistas disponibles para que en la imagen A y B se esté mostrando la misma información anatómica.

===Módulos===

Los módulos de registrado se pueden encontrar en la mitad inferior del desplegable de módulos (<xr id="fig:Registrado" />), están agrupados bajo el nombre ''Registration'':

<figure id="fig:Registrado">
[[File:Reg01.png|none|thumb|<caption>registration modules</caption>]]
</figure>

Tradicionalmente se ha utilizado el registrado en imágenes cerebrales, de ahí que varios de los módulos estén orientados a estos casos específicos.

====Terminología====
* Landmark: puntos representativos de la imagen (seleccionados por el usuario en ambas imágenes) para asegurar la coincidencia
* Fixed volume: imagen que no va a sufrir transformación alguna
* Moving volume: imagen que se va a transformar para hacerla coincidir con la que se ha seleccionado como ''fixed volume''

==Ejemplo: landmark registration==
===Carga de volúmenes===
Una vez cargados los dos juegos de imágenes, se abre el módulo '''Registration\Landmark registration'''. En ese momento el módulo pide al usuario que determine cual va a ser el ''fixed volume'' y el ''moving volume'' (<xr id="fig:Registrado2" />) utilizando los desplegables, al hacer click en cada uno de ellos se puede ver cuales son los volúmenes cargados en la escena actual y seleccionar el que corresponda.

<figure id="fig:Registrado2">
[[File:Reg02.png|none|thumb|<caption>fixed and moving volumes</caption>]]
</figure>

La distribución de la pantalla cambia y pasa a ser una rejilla de 3x3 (<xr id="fig:Registrado3" />). Por columnas, se muestran las vistas axial, coronal y sagital en las columnas 1, 2 y 3 (esta es la distribución por defecto, a no ser que el usuario decida modificarlo). Por filas se muestra el ''fixed volume'' en la fila 1, el ''moving volume'' en la fila 2 y el resultado de la superposición de ambos en la fila 3, que pasará a llamarse ''-transformed''.

<figure id="fig:Registrado3">
[[File:Reg03.png|none|thumb|<caption>registration layout</caption>]]
</figure>

===Selección layout===
Si se desea modificar este layout, se hará desde el panel del módulo, modificando las siguientes opciones (<xr id="fig:Registrado4" />). Si no fuera relevante alguna de las vistas se puede desactivar y así no ocupa espacio en pantalla, controlar la transparencia de la superposición de imágenes e incluso el zoom:

<figure id="fig:Registrado4">
[[File:Reg04.png|none|thumb|<caption>layout</caption>]]
</figure>

También, si se desea cambiar los volúmenes con los que se esté trabajando, un poco más arriba en el panel del módulo, utilizando el botón '''Select Volumes to Register''' se vuelve al menú de selección descrito en <xr id="fig:Registrado2" />.

Por ejemplo, seleccionando ''Coronal'' el layout queda así (<xr id="fig:Registrado5" />):

<figure id="fig:Registrado5">
[[File:Reg05.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

===Landmarks===
Los puntos de cotejamiento, o landmarks, se añaden en el apartado ''Landmarks'' del panel del módulo, situado justo debajo de los descritos anteriormente (<xr id="fig:Registrado6" />).

<figure id="fig:Registrado6">
[[File:Reg06.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

Se pulsa el botón ADD y se sitúa el punto (el cursor cambia automáticamente y pasamos a estar en modo fiducials) en el ''fixed volume'' haciendo click en el lugar deseado. El programa situará automáticamente ese mismo punto (llamado L-0 en la imagen de ejemplo) en el ''moving volume''. Lo ideal es que estos puntos se coloquen en elementos representativos de ambas imágenes y que sean fácilmente identificables.

Ahora, tal y como se ve en la imagen (<xr id="fig:Registrado7" />), el usuario ha puesto el punto en la vista de la primera columna (verde) y Slicer ha puesto el punto en la vista de la segunda columna (amarilla). El landmark de la ''moving volume'' no está en el mismo lugar que el de la imagen de la ''fixed volume'' (Slicer simplemente lo sitúa en las mismas coordenadas, sin tener en cuenta la imagen y lo que en ella se representa), así que para corregir su localización se hace click en el botón REFINE LANDMARK que está justo debajo de la lista de landmarks presentes en el registrado actual. Entonces podremos desplazar manualmente, pinchando y arrastrando, el landmark del ''moving volume'' hasta la posición que consideremos visualmente correcta.

<figure id="fig:Registrado7">
[[File:Reg07.png|none|thumb|<caption>landmak point</caption>]]
</figure>

Se continúa añadiendo landmarks hasta considerar que se han puesto los necesarios para el ajuste correcto de ambas imágenes, en este punto del proceso de trabajo dispondremos de un conjunto de puntos (<xr id="fig:Registrado8" />), que vienen definidos por su nombre. Se pueden seleccionar haciendo click en el cursor con el icono del ''crosshair'' y eliminarse con el icono de la papelera.

<figure id="fig:Registrado8">
[[File:Reg08.png|none|thumb|<caption>landmak list</caption>]]
</figure>

El refinado de los landmarks puede apoyarse en dos métodos de refinamiento, BRAINSFit y SimpleITK, pero ninguno de estos métodos suple al operador y a su criterio.

===Registrado===

No existe un canon que determine el método de registrado a aplicar, puesto que depende de diferentes factores en cada caso, como pueden ser el tipo de imágenes con las que se trabaje, la calidad de las mismas, la anatomía que se esté visualizando y los resultados esperados. Un método estándard y bastante abierto a configuración por parte del usuario es el de la '''Affine Registration'' (<xr id="fig:Registrado9" />), que permite estos tres niveles de ajuste:
*Rigid: permite traslaciones y rotaciones
*Similarity: rigid + cambios de escala uniforme
*Affine: Similarity + deformación
La transformación afín se denomina también transformación lineal y viene definida por diferentes matrices para pasar de un conjunto de coordenadas iniciales a otras [[https://en.wikipedia.org/wiki/Affine_transformation| Wikpedia Affine Transformation]].

<figure id="fig:Registrado9">
[[File:Reg09.png|none|thumb|<caption>linear registration</caption>]]
</figure>

Dependiendo de la calidad y cantidad de landmarks seleccionados el registrado será más o menos exacto y es tarea del operador ir refinando los landmarks para que el resultado sea lo más óptimo posible.

<hr>
[[Clínicos 3D Slicer| MENU]]

Translations:Registrado/3/pt

2018-09-27T18:19:20Z

Artemisa: Página creada con «Mediante esta comparação de imagem estudam-se as diferenças entre ambas, mas para que isto seja possível da maneira mais intuitiva possível se tem de conseguir a coinc...»

Mediante esta comparação de imagem estudam-se as diferenças entre ambas, mas para que isto seja possível da maneira mais intuitiva possível se tem de conseguir a coincidência por sobreposição o mais exacta possível. Isto tem de se fazer com duas imagens que, além de ter sido tomadas em momentos temporários diferentes, podem provir de equipas diferentes (outro modelo de scanner, por exemplo) e nos que não se pode garantir que a posição na que estava colocado o paciente tem sido exactamente a mesma (variações em orientação e deslocação).

Registrado/pt

2018-09-27T18:19:20Z

__NOTOC__ __NOEDITSECTION__
<languages />

==Registado==
O registado é o processo mediante o qual se sobrepõem de forma coincidente duas imagens médicas tomadas em momentos temporários diferentes, correspondentes à mesma parte do corpo e geralmente ao mesmo paciente, a fim de poder comprovar a evolução de uma lesão/doença/operação.

Mediante esta comparação de imagem estudam-se as diferenças entre ambas, mas para que isto seja possível da maneira mais intuitiva possível se tem de conseguir a coincidência por sobreposição o mais exacta possível. Isto tem de se fazer com duas imagens que, além de ter sido tomadas em momentos temporários diferentes, podem provir de equipas diferentes (outro modelo de scanner, por exemplo) e nos que não se pode garantir que a posição na que estava colocado o paciente tem sido exactamente a mesma (variações em orientação e deslocação).

Un resumen de los posibles escenarios de registrado es:
*estructuras anatómicas cuasi coincidentes: dos imágenes en las que las mismas estructuras anatómicas, de tamaño similar, están presentes en ambas.
*variaciones en la talla del paciente: particularmente en el caso de niños, donde el crecimiento natural hace que existan diferencias de tamaño del cuerpo entero.
*estructuras anatómicas con volúmenes diferentes: cuando se va a estudiar la evolución de una masa tumoral que ha ido creciendo con el tiempo, esta ha aumentado de volumen en una de las imágenes (puede ser la más reciente o la más antigua) y puede que haya desplazado a otras estructuras anatómicas u órganos colindantes.
*estructuras anatómicas inexistentes: tras una cirugía (o tratamiento) en la que se ha practicado una extirpación de parte de tejido (órgano, tumor, hueso, etc...) se han de cotejar pares de en las que hay elementos que no existen en una de las imágenes.

===Descripción del procedimiento===

En líneas generales el procedimiento a seguir es el de cargar ambas imágenes una junto a la otra, identificar puntos comunes en cada una (los puntos van emparejados, se toma uno en la imagen A y otro en la imagen B. Si ambas imágenes presentan la misma orientación, no será necesario aplicar distorsión alguna para hacerlas coincidir; pero esto no suele ser lo más común. Entonces se ha de seleccionar cual de las dos imágenes con las que se trabaja (A o B) se va a aplicar una distorsión para lograr la coincidencia plena.

A la hora de determinar los puntos comunes en ambas imágenes, puede ser necesario moverse entre las diferentes slices de las tres vistas disponibles para que en la imagen A y B se esté mostrando la misma información anatómica.

===Módulos===

Los módulos de registrado se pueden encontrar en la mitad inferior del desplegable de módulos (<xr id="fig:Registrado" />), están agrupados bajo el nombre ''Registration'':

<figure id="fig:Registrado">
[[File:Reg01.png|none|thumb|<caption>registration modules</caption>]]
</figure>

Tradicionalmente se ha utilizado el registrado en imágenes cerebrales, de ahí que varios de los módulos estén orientados a estos casos específicos.

====Terminología====
* Landmark: puntos representativos de la imagen (seleccionados por el usuario en ambas imágenes) para asegurar la coincidencia
* Fixed volume: imagen que no va a sufrir transformación alguna
* Moving volume: imagen que se va a transformar para hacerla coincidir con la que se ha seleccionado como ''fixed volume''

==Ejemplo: landmark registration==
===Carga de volúmenes===
Una vez cargados los dos juegos de imágenes, se abre el módulo '''Registration\Landmark registration'''. En ese momento el módulo pide al usuario que determine cual va a ser el ''fixed volume'' y el ''moving volume'' (<xr id="fig:Registrado2" />) utilizando los desplegables, al hacer click en cada uno de ellos se puede ver cuales son los volúmenes cargados en la escena actual y seleccionar el que corresponda.

<figure id="fig:Registrado2">
[[File:Reg02.png|none|thumb|<caption>fixed and moving volumes</caption>]]
</figure>

La distribución de la pantalla cambia y pasa a ser una rejilla de 3x3 (<xr id="fig:Registrado3" />). Por columnas, se muestran las vistas axial, coronal y sagital en las columnas 1, 2 y 3 (esta es la distribución por defecto, a no ser que el usuario decida modificarlo). Por filas se muestra el ''fixed volume'' en la fila 1, el ''moving volume'' en la fila 2 y el resultado de la superposición de ambos en la fila 3, que pasará a llamarse ''-transformed''.

<figure id="fig:Registrado3">
[[File:Reg03.png|none|thumb|<caption>registration layout</caption>]]
</figure>

===Selección layout===
Si se desea modificar este layout, se hará desde el panel del módulo, modificando las siguientes opciones (<xr id="fig:Registrado4" />). Si no fuera relevante alguna de las vistas se puede desactivar y así no ocupa espacio en pantalla, controlar la transparencia de la superposición de imágenes e incluso el zoom:

<figure id="fig:Registrado4">
[[File:Reg04.png|none|thumb|<caption>layout</caption>]]
</figure>

También, si se desea cambiar los volúmenes con los que se esté trabajando, un poco más arriba en el panel del módulo, utilizando el botón '''Select Volumes to Register''' se vuelve al menú de selección descrito en <xr id="fig:Registrado2" />.

Por ejemplo, seleccionando ''Coronal'' el layout queda así (<xr id="fig:Registrado5" />):

<figure id="fig:Registrado5">
[[File:Reg05.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

===Landmarks===
Los puntos de cotejamiento, o landmarks, se añaden en el apartado ''Landmarks'' del panel del módulo, situado justo debajo de los descritos anteriormente (<xr id="fig:Registrado6" />).

<figure id="fig:Registrado6">
[[File:Reg06.png|none|thumb|<caption>coronal layout</caption>]]
</figure>

Se pulsa el botón ADD y se sitúa el punto (el cursor cambia automáticamente y pasamos a estar en modo fiducials) en el ''fixed volume'' haciendo click en el lugar deseado. El programa situará automáticamente ese mismo punto (llamado L-0 en la imagen de ejemplo) en el ''moving volume''. Lo ideal es que estos puntos se coloquen en elementos representativos de ambas imágenes y que sean fácilmente identificables.

Ahora, tal y como se ve en la imagen (<xr id="fig:Registrado7" />), el usuario ha puesto el punto en la vista de la primera columna (verde) y Slicer ha puesto el punto en la vista de la segunda columna (amarilla). El landmark de la ''moving volume'' no está en el mismo lugar que el de la imagen de la ''fixed volume'' (Slicer simplemente lo sitúa en las mismas coordenadas, sin tener en cuenta la imagen y lo que en ella se representa), así que para corregir su localización se hace click en el botón REFINE LANDMARK que está justo debajo de la lista de landmarks presentes en el registrado actual. Entonces podremos desplazar manualmente, pinchando y arrastrando, el landmark del ''moving volume'' hasta la posición que consideremos visualmente correcta.

<figure id="fig:Registrado7">
[[File:Reg07.png|none|thumb|<caption>landmak point</caption>]]
</figure>

Se continúa añadiendo landmarks hasta considerar que se han puesto los necesarios para el ajuste correcto de ambas imágenes, en este punto del proceso de trabajo dispondremos de un conjunto de puntos (<xr id="fig:Registrado8" />), que vienen definidos por su nombre. Se pueden seleccionar haciendo click en el cursor con el icono del ''crosshair'' y eliminarse con el icono de la papelera.

<figure id="fig:Registrado8">
[[File:Reg08.png|none|thumb|<caption>landmak list</caption>]]
</figure>

El refinado de los landmarks puede apoyarse en dos métodos de refinamiento, BRAINSFit y SimpleITK, pero ninguno de estos métodos suple al operador y a su criterio.

===Registrado===

No existe un canon que determine el método de registrado a aplicar, puesto que depende de diferentes factores en cada caso, como pueden ser el tipo de imágenes con las que se trabaje, la calidad de las mismas, la anatomía que se esté visualizando y los resultados esperados. Un método estándard y bastante abierto a configuración por parte del usuario es el de la '''Affine Registration'' (<xr id="fig:Registrado9" />), que permite estos tres niveles de ajuste:
*Rigid: permite traslaciones y rotaciones
*Similarity: rigid + cambios de escala uniforme
*Affine: Similarity + deformación
La transformación afín se denomina también transformación lineal y viene definida por diferentes matrices para pasar de un conjunto de coordenadas iniciales a otras [[https://en.wikipedia.org/wiki/Affine_transformation| Wikpedia Affine Transformation]].

<figure id="fig:Registrado9">
[[File:Reg09.png|none|thumb|<caption>linear registration</caption>]]
</figure>

Dependiendo de la calidad y cantidad de landmarks seleccionados el registrado será más o menos exacto y es tarea del operador ir refinando los landmarks para que el resultado sea lo más óptimo posible.

<hr>
[[Clínicos 3D Slicer| MENU]]

Translations:Registrado/1/pt

2018-09-27T18:18:50Z

Artemisa: Página creada con «==Registado== O registado é o processo mediante o qual se sobrepõem de forma coincidente duas imagens médicas tomadas em momentos temporários diferentes, correspondente...»

==Registado==
O registado é o processo mediante o qual se sobrepõem de forma coincidente duas imagens médicas tomadas em momentos temporários diferentes, correspondentes à mesma parte do corpo e geralmente ao mesmo paciente, a fim de poder comprovar a evolução de uma lesão/doença/operação.

2018-09-27T18:11:46Z

Artemisa:

Este módulo complementa-se com o [[Segment Editor|Segment Editor]]. Ambos servem para segmentar volumes, mas o '''Segment Editor''' se pode considerar como uma versão avançada do '''Editor'''; o que muda entre ambos são as ferramentas disponíveis para trabalhar e a forma em que algumas se comportam. De facto no ecrã do módulo recomenda o uso do módulo Segment Editor. (<xr id="fig:ModuleEditor" />)
<figure id="fig:ModuleEditor">
[[File:ModuleEditor01.png|center|frame|<caption>Module Editor</caption>]]
</figure>

Translations:Módulos y extensiones/72/pt

2018-09-27T18:08:47Z

Artemisa:

(<xr id="fig:ModuleVolumeR2" />)
<figure id="fig:ModuleVolumeR2">
[[File:ModuleVolumeRendering02.png|center|frame|<caption>Module Volume Rendering - Advanced</caption>]]
</figure>