Diferencia entre revisiones de «Interfaz OpenAnatomy»

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En la página principal el menú nos conmina a elegir qué atlas deseamos abrir. Se selecciona uno de ellos (en este caso el del cerebro) y se pasa a la página del mismo. Para ello ha de cargar los ficheros que componen el atlas en sí, y una pantalla superpuesta nos informa del progreso de la carga:
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==Ventana principal== <!--T:1-->
  
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En la página principal el menú nos obliga a elegir qué atlas deseamos abrir. Se selecciona uno de ellos (en este caso el del cerebro) y se pasa a la página del mismo. Para ello se han de cargar los ficheros que componen el atlas en sí, y una ventana superpuesta nos informa del progreso de la carga:
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Cuando la carga ha finalizado, se puede cerrar la ventana superpuesta (en el botón OK o haciendo clic en cualquier parte de la pantalla) y nos encontramos en la interfaz propiamente dicha (<xr id="fig:pantalla-oa" />):
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==Descripción de la interfaz== <!--T:6-->
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Esta interfaz se asemeja a la de 3D Slicer: en la parte izquierda están las tres vistas (axial, coronal y sagital), en la parte central la representación tridimensional, y en la parte derecha está la jerarquía de elementos presentes en el atlas.
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===Barra de menú=== <!--T:8-->
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En la parte superior de la ventana está la barra de herramientas (<xr id="fig:pantalla-oa" />):
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[[File:Oa-toolbar.png|none|thumb|<caption>Open Anatomy Toolbar</caption>]]
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Los botones de la barra, de izquierda a derecha, son:
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* ''Threshold and label map transparency'': para controlar la transparencia y saturación de las vistas 2D y su representación en la ventana 3D
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* ''Toggle the crosshair in the slice views'': activa/desactiva líneas en las vistas 2D para indicar la sección que se está mostrando
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* ''Resize the view to fit the whole scene'': reorienta la vista 3D y la encaja en la ventana (muy útil para cuando se ha aplicado un nivel de zoom excesivo o se ha movido el modelo fuera de la pantalla)
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* ''Volumes to display'': lista de los volúmenes disponibles en el atlas cargado
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* ''View sharing'': activando/desactivando la casilla se permite/bloquea compartir la vista con otros navegadores que estén cargando la misma sesión
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* ''Screenshot'': hace una captura de pantalla
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* ''Log in'': funcionalidad no implementada aún
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===Vistas 2D=== <!--T:12-->
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Al igual que en 3D Slicer, cada vista 2D se puede manipular mediante la barra deslizante que nos mueve entre el conjunto de vistas (''slices''). Haciendo clic en el icono del ojo se cambia la visibilidad del plano de la sección en la parte de la ventana que muestra la vista 3D.
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===Vista 3D=== <!--T:14-->
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En la parte inferior izquierda están representados los ejes, que sirven para saber la orientación del modelo que se muestra en cada momento. El sistema de ejes utilizado es el RAS, al igual que en 3D Slicer.
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En la parte inferior derecha hay un pequeño recuadro que muestra los parámetros de la animación: el número de FPS (''Frames Per Second''). Esta información es irrelevante desde el punto de vista anatómico, simplemente indica la fluidez con la que se muestra el movimiento en la ventana.
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La representación 3D se manipula pinchando y arrastrando con el botón izquierdo del ratón. Al pinchar y arrastrar con el botón derecho se desplaza la representación 3D por la pantalla, y al utilizar la rueda de desplazamiento del ratón se cambia el zoom.
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Al pasar el ratón por encima de un elemento, en la parte inferior de la pantalla, muestra el nombre del mismo y su posición en el árbol jerárquico de elementos. Si se hace clic sobre él aparecerá marcado en amarillo.
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===Árbol de elementos=== <!--T:18-->
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La parte derecha da la información jerárquica de los elementos disponibles en la escena.
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Haciendo clic en los iconos '''+''' se despliega el elemento ''padre'' para mostrar los elementos ''hijos'' y haciendo clic en '''-''' se contrae. La visibilidad de los elementos (y todos aquellos que dependen jerárquicamente de él) se controla con el icono del ojo.
  
  
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[[Clínicos 3D Slicer| MENU]]
  
 
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Revisión actual del 11:20 30 ago 2018

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Ventana principal

En la página principal el menú nos obliga a elegir qué atlas deseamos abrir. Se selecciona uno de ellos (en este caso el del cerebro) y se pasa a la página del mismo. Para ello se han de cargar los ficheros que componen el atlas en sí, y una ventana superpuesta nos informa del progreso de la carga:

(Figure 1)

Figure 1: Load screen

Cuando la carga ha finalizado, se puede cerrar la ventana superpuesta (en el botón OK o haciendo clic en cualquier parte de la pantalla) y nos encontramos en la interfaz propiamente dicha (Figure 2):


Figure 2: Open Anatomy Interface

Descripción de la interfaz

Esta interfaz se asemeja a la de 3D Slicer: en la parte izquierda están las tres vistas (axial, coronal y sagital), en la parte central la representación tridimensional, y en la parte derecha está la jerarquía de elementos presentes en el atlas.

Barra de menú

En la parte superior de la ventana está la barra de herramientas (Figure 2):

Figure 3: Open Anatomy Toolbar

Los botones de la barra, de izquierda a derecha, son:

  • Threshold and label map transparency: para controlar la transparencia y saturación de las vistas 2D y su representación en la ventana 3D
  • Toggle the crosshair in the slice views: activa/desactiva líneas en las vistas 2D para indicar la sección que se está mostrando
  • Resize the view to fit the whole scene: reorienta la vista 3D y la encaja en la ventana (muy útil para cuando se ha aplicado un nivel de zoom excesivo o se ha movido el modelo fuera de la pantalla)
  • Volumes to display: lista de los volúmenes disponibles en el atlas cargado
  • View sharing: activando/desactivando la casilla se permite/bloquea compartir la vista con otros navegadores que estén cargando la misma sesión
  • Screenshot: hace una captura de pantalla
  • Log in: funcionalidad no implementada aún

Vistas 2D

Al igual que en 3D Slicer, cada vista 2D se puede manipular mediante la barra deslizante que nos mueve entre el conjunto de vistas (slices). Haciendo clic en el icono del ojo se cambia la visibilidad del plano de la sección en la parte de la ventana que muestra la vista 3D.

Vista 3D

En la parte inferior izquierda están representados los ejes, que sirven para saber la orientación del modelo que se muestra en cada momento. El sistema de ejes utilizado es el RAS, al igual que en 3D Slicer.

En la parte inferior derecha hay un pequeño recuadro que muestra los parámetros de la animación: el número de FPS (Frames Per Second). Esta información es irrelevante desde el punto de vista anatómico, simplemente indica la fluidez con la que se muestra el movimiento en la ventana.

La representación 3D se manipula pinchando y arrastrando con el botón izquierdo del ratón. Al pinchar y arrastrar con el botón derecho se desplaza la representación 3D por la pantalla, y al utilizar la rueda de desplazamiento del ratón se cambia el zoom.

Al pasar el ratón por encima de un elemento, en la parte inferior de la pantalla, muestra el nombre del mismo y su posición en el árbol jerárquico de elementos. Si se hace clic sobre él aparecerá marcado en amarillo.

Árbol de elementos

La parte derecha da la información jerárquica de los elementos disponibles en la escena.

Haciendo clic en los iconos + se despliega el elemento padre para mostrar los elementos hijos y haciendo clic en - se contrae. La visibilidad de los elementos (y todos aquellos que dependen jerárquicamente de él) se controla con el icono del ojo.



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