Interface OpenAnatomy

Fenêtre principale

Sur la page d'accueil, le menu nous invite à choisir l'atlas que nous voulons ouvrir. Sélectionnez l'un d'entre eux (dans ce cas-ci le cerveau) et allez à la page du même. Pour ce faire, vous devez télécharger les fichiers qui composent l'atlas lui-même, et une fenêtre de superposition nous informe de l'avancement du téléchargement:

(Figure 1)

Figure 1: Load screen

Une fois le chargement terminé, vous pouvez fermer la fenêtre de superposition (sur le bouton OK ou en cliquant sur n'importe quelle partie de l'écran) et vous vous retrouverez dans l'interface elle-même (Figure 2):

Figure 2: Open Anatomy Interface

Description de l'interface

Cette interface ressemble à celle de 3D Slicer: à gauche les trois vues (axiale, coronale et sagittale), au centre la représentation tridimensionnelle, et à droite la hiérarchie des éléments présents dans l'atlas.

Barre des menus

En haut de la fenêtre se trouve la barre d'outils (Figure 2):

Figure 3: Open Anatomy Toolbar

Les boutons de la barre, de gauche à droite, sont:

• Threshold and label map transparency: ppour contrôler la transparence et la saturation des vues 2D et leur représentation dans la fenêtre 3D.
• Toggle the crosshair in the slice views: activer/désactiver les lignes dans les vues 2D pour indiquer quelle section est affichée.
• Resize the view to fit the whole scene: Réorienter la vue 3D et l'insérer dans la fenêtre (très utile lorsqu'un niveau de zoom excessif a été appliqué ou que le modèle a été déplacé hors de l'écran)
• Volumes to display: lliste des volumes disponibles dans l'atlas chargé
• View sharing: activer/désactiver la case à cocher permet/bloquer le partage de vues avec d'autres navigateurs qui chargent la même session.
• Screenshot: faire une capture d'écran
• Log in: fonctionnalité pas encore implémentée

Vues 2D

Al igual que en el 3D Slicer, cada vista 2D se puede manipular mediante la barra deslizante que nos mueve entre el conjunto de vistas (slices). Haciendo click en el icono del ojo se cambia la visibilidad del plano de la sección en la parte de la ventana que muestra la vista 3D.

Vista 3D

En la parte inferior izquierda están representados los ejes, que ayuda a saber la orientación del modelo que se muestra en cada momento. El sistema de ejes utilizado es el RAS, al igual que en 3d Slicer.

En la parte inferior derecha hay un pequeño recuadro que muestra los parámetros de la animación: el número de FPS (Frames Per Second). Esta información es irrelevante desde el punto de vista anatómico, simplemente indica la fluidez con la que se muestra el movimiento en la ventana.

La representación 3D se manipula pinchando y arrastrando con el botón izquierdo del ratón. Al pinchar y arrastrar con el botón derecho se desplaza la representación 3D por la pantalla; y al utilizar la rueda de desplazamiento del ratón se cambia el zoom.

Al pasar el ratón por encima de un elemento, en la parte inferior de la pantalla, muestra el nombre del mismo y su posición en el árbol jerárquico de elementos. Si se hace click sobre el aparecerá marcado en amarillo.

Árbol de elementos

La parte derecha da la información jerárquica de los elementos disponibles en la escena.

Haciendo click en los iconos + se despliega el elemento padre para mostrar los elementos hijos y haciendo click en - se contrae. La visibilidad de los elementos (y todos aquellos que dependen jerárquicamente de él) se controla con el icono del ojo.