Diferencia entre revisiones de «Editor/fr»

Revisión del 12:52 27 feb 2018

Editor Module

Ce module est complété par l'éditeur de segment Segment Editor. Les deux servent à segmenter les volumes, mais l'éditeur de segments peut être considéré comme une version avancée de l'éditeur. quels sont les changements entre eux sont les outils disponibles pour travailler. En fait, l'écran du module recommande l'utilisation du module Segment Editor.(Figure 1)

Figure 1: Module Editor

Sections

À l'entrer dans le module Éditeur s'ouvre un tableau de dialogue en demandant quelle table de couleurs se va à utiliser en le travail.

Une table de couleurs associe les valeurs scalaires de l'image médicale à la couleur à utiliser dans sa représentation dans Slicer. Certaines modalités médicales, telles que CT, fournissent des valeurs absolues qui permettent d'établir la corrélation entre les types de tissus et les valeurs scalaires de l'image. Cependant, dans d'autres modalités comme le MRI, cela ne se produit pas parce que les valeurs sont relatives; il est nécessaire d'effectuer cette corrélation semi-automatiquement.

Il y a plus information sur les différentes tables de couleur disponibles par défaut en Slicer dedans de la documentation du module [Colors], dans la section Categories.

Create and Select Label Maps

• Volume principal: Contient les images originales du scanner. Vous pouvez sélectionner entre tous les volumes différents que vous avez chargés dans la scène.
• Volume de fusion: Contient les représentations de la scène à laquelle la carte de couleurs correspondante a été appliquée.

Voir ???.

Edit Selected Label Map

Première file

Figure 2: Module Editor - Toolbar row 1

• Default Tool: permet la sélection des éléments
• Erase Label: Effacer les modifications apportées à l'image
• Paint Effect: Colore la zone sur laquelle tu cliques et glisse sur la souris. Lorsque vous sélectionnez cet outil, les options suivantes s'affichent sous les deux barres d'outils: l'étiquette de la brosse, le rayon de la pointe du pinceau et le comportement de la couleur appliquée. Il fonctionne en cliquant avec le bouton gauche de la souris et en faisant glisser, pour faire un dessin à main levée.
• Draw Effet: similaire au précédent mais basé sur des lignes droites définies en fonction des clics.
• Wand Effect: sélectionnez tous les pixels de couleur similaire, en fonction du jeu de tolérance, lorsque vous cliquez dessus.
• Level Tracing Effect: délimite avec une ligne tous les pixels dont la valeur est similaire à celle sélectionnée et clique gauche pour exporter la ligne de contour vers la carte d'étiquette.
• Rectangle Effect: faire une sélection avec une forme rectangulaire en cliquant avec le bouton gauche et en faisant glisser, relâcher ferme le rectangle.
• Identify Islands Effect: applique une étiquette unique à l'ensemble de la zone interconnectée dans la carte de l'étiquette. Dans le cas où il y a d'autres zones avec les mêmes valeurs, mais pas connectées à celles sélectionnées, elles ne seront pas modifiées ou sélectionnées.
• Change Island Effect: applique une couleur différente au contour fermé sélectionné.
• Remove Islands Effect: supprime tous les pixels / voxels non étiquetés dans une zone marquée et les remplace par des valeurs identiques à celles de la zone marquée. Il est utilisé pour éliminer trous / bruit dans les sélections.
• Save Island Effect: se comporte comme l'outil précédent et permet également d'enregistrer la sélection pour des utilisations ultérieures.

Deuxième file

Figure 3: Module Editor - Toolbar row 2

• Erode Effect: réduit la sélection le nombre de pixels définis dans les options de l'outil.
• Dilate Effect: étend la sélection le nombre de pixels définis dans les options de l'outil.
• Grow Cut Effect: se compose d'un algorithme qui segmente en fonction de plusieurs étiquettes de couleur pour séparer automatiquement les zones appartenant aux structures anatomiques sélectionnées.
• Watershed from Marker Effect: Algorithme similaire au précédent, utilisé lorsque des objets avec des bords bien définis sont disponibles.
• Threshold Effect: Définit les portées pour les valeurs seuils qui seront utilisées lors de la peinture, par exemple. Un seuil supérieur et inférieur est défini.
• Change Label Effect: pour changer chaque pixel / voxel dans la carte d'étiquette d'entrée à la valeur de la carte d'étiquette de sortie (du volume principal au volume de fusion).
• Make Model Effect: crée automatiquement des modèles pour toutes les valeurs autres que zéro dans la carte des étiquettes.
• Fast Marching Effect: vous permet de sélectionner par un algorithme de segmentation, des zones de valeurs similaires à celles définies comme valeur de graine automatiquement.

Documentation en Slicer.org

[Editor] (en anglais)

Flux de travail

La procédure à suivre, à des grands traits, est le suivant:

1. Abrir la escena/ficheros con los datos y entrar en el módulo editor
2. Seleccionar uno de los label maps que hay en slicer, para que asigne etiquetas a los colores/intensidades con los que trabajar
3. Con la herramienta Paint Effect asignarle una etiqueta (del label map anteriormente seleccionado) y pintar la zona correspondiente en la imagen
4. Repetir el paso anterior para cada tipo de tejido que se quiera segmentar
5. Aplicar el efecto Grow Cut para que Slicer automáticamente seleccione todas las áreas similares a las selecionadas

En este momento ya estará hecha la segmentación y se pasa a generar los volúmenes que le corresponden:

1. Aplicar, dentro de la pestaña Per-structure Volumes el efecto Split Merge Volume. Así se crea un volumen independiente por cada estructura segmentada.
2. Ajustar cada volumen con la herramienta Threshold Effect, comprobando que se selecciona lo anatómicamente correcto en ese caso
3. Depurar la seleccion, eliminando islas o añadiendo partes según sea necesario
4. Cuando ya se hayan ajustado los volúmenes, crear los volúmenes 3D definitivos con el comando Merge and Build