Diferencia entre revisiones de «Segment Editor»

Revisión del 14:33 27 feb 2018

Módulo Segment Editor

Esta es la versión avanzada del módulo editor, en este las herramientas se han mejorado y el flujo de trabajo varía al haber más posibilidades en la interacción con los datos. (Figure 1)

Figure 1: Module Segment Editor

Interfaz

Ahora el módulo permite trabajar con distintos conjuntos de segmentaciones, en función del volumen con el que se esté interactuando, como se puede ver en los dos primeros menús desplegables de la interfaz.

Las segmentaciones se van generando individualmente, mediante la barra de botones que aparece a continuación de estos menús(Figure 2):

Figure 2: Segments bar

Las funciones de estos botones son bastante intuitivas:

• Add: crea una nueva segmentación
• Remove: elimina la segmentación seleccionada
• Show 3D: muestra las segmentaciones activas en 3D
• Segmentations: nos lleva al módulo de ese nombre

Effects

Figure 3: Effects

Las dos primeras filas de iconos corresponden al módulo Segment Editor propiamente dicho, pero la tercera es de la extensión SegmentEditorExtraEffects, la cual se recomienda instalar, pues complementa a este módulo.

primera fila

Figure 4: Effects row1

• None: devuelve al puntero a su comportamiento por defecto
• Paint: pinta (selecciona) zonas de la imagen
• Draw: delimita contornos para dibujar
• Erase: borra las zonas marcadas con las dos herramientas anteriores
• Level tracing: traza zonas de intensidad similar
• Grow from seeds: crea segmentaciones a partir de zonas marcadas con la herramienta paint
• Fill between slices: segmenta entre diferentes secciones del volumen
• Threshold: umbral. Selecciona zonas de intensidad afín por toda la imagen.

segunda fila

Figure 5: Effects row2

• Margin: amplía la selección en un incremento fijo
• Smoothing: suaviza la superficie de la selección
• Scissors: corta (elimina) partes de la selección
• Islands: manipula con las superficies independientes dentro de la segmentación. Esta herramienta se explica en profundidad más adelante
• Logical operators: operaciones con operadores lógicos entre segmentaciones
• Fast marching:
• Flood filling: relleno de área

tercera fila: extra effects

Figure 6: Effects row3: extra effects

• Mask volume: Utilice el segmento seleccionado como máscara. La máscara se aplica al volumen maestro por defecto.

La operación de llenado interior y exterior crea un volumen de mapa de etiquetas binario como salida, con los valores de llenado interior y exterior modificables. (de la descripción de la herramienta)

• Surface cut: Use marcas de referencia para rellenar un segmento. La superficie se genera a partir de los puntos colocados. (de la descripción de la herramienta)
• Watershed: Crece segmentos para crear una segmentación completa. Se tienen en cuenta la ubicación, el tamaño y la forma de los segmentos iniciales y el contenido del volumen maestro. Los límites finales del segmento se colocarán donde el brillo del volumen maestro cambia bruscamente. (de la descripción de la herramienta)

Documentación en Slicer.org

[Segment Editor] (en inglés)