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(Página creada con «==Module Segment Editor==»)
 
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<languages />
 
<languages />
 
==Module Segment Editor==
 
==Module Segment Editor==
  
−
Esta es la versión avanzada del módulo editor, en este las herramientas se han mejorado y el flujo de trabajo varía al haber más posibilidades en la interacción con los datos. (<xr id="fig:ModuleSegmentEditor" />)
+
C'est la version avancée du module éditeur, en cela les outils ont été améliorés et le flux de travail varie car il y a plus de possibilités dans l'interaction avec les données. (<xr id="fig:ModuleSegmentEditor" />)
  
 
<figure id="fig:ModuleSegmentEditor">
 
<figure id="fig:ModuleSegmentEditor">
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</figure>
 
</figure>
  
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===Interfaz===
+
===Interface===
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Ahora el módulo permite trabajar con distintos conjuntos de segmentaciones, en función del volumen con el que se esté interactuando, como se puede ver en los dos primeros menús desplegables de la interfaz.
+
Le module vous permet maintenant de travailler avec différents ensembles de segmentations, en fonction du volume avec lequel vous interagissez, comme vous pouvez le voir dans les deux premiers menus déroulants de l'interface.
  
−
Las segmentaciones se van generando individualmente, mediante la barra de botones que aparece a continuación de estos menús(<xr id="fig:ModuleSegmentEditor2" />):
+
Les segmentations sont générées individuellement, au moyen de la barre de boutons qui apparaît à côté de ces menus.(<xr id="fig:ModuleSegmentEditor2" />):
  
 
<figure id="fig:ModuleSegmentEditor2">
 
<figure id="fig:ModuleSegmentEditor2">
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</figure>
 
</figure>
  
−
Las funciones de estos botones son bastante intuitivas:
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Les fonctions de ces boutons sont très intuitives :
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* Add: crea una nueva segmentación
+
*Ajouter: crée une nouvelle segmentation
−
* Remove: elimina la segmentación seleccionada
+
*Supprimer: supprime la segmentation sélectionnée.
−
* Show 3D: muestra las segmentaciones activas en 3D
+
*Spectacle 3D: montre les segmentations 3D actives.
−
* Segmentations: nos lleva al módulo de ese nombre
+
*Segmentations: conduit au module de ce nom.
  
 
====Effects====
 
====Effects====
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</figure>
 
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Las dos primeras filas de iconos corresponden al módulo '''Segment Editor''' propiamente dicho, pero la tercera es de la extensión '''SegmentEditorExtraEffects''', la cual se recomienda instalar, pues complementa a este módulo.
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Les deux premières rangées d'icônes correspondent au module '''Segment Editor''' lui-même, mais la troisième est l'extension '''SegmentEditorExtraEffects''', qu'il est recommandé d'installer, car elle complète ce module.
  
 
=====primera fila=====
 
=====primera fila=====
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</figure>
 
</figure>
  
−
*None: devuelve al puntero a su comportamiento por defecto
+
*None: ramène le pointeur à son comportement par défaut.
−
*Paint: pinta (selecciona) zonas de la imagen
+
*Paint: Peindre (sélectionner) les zones de l'image.
−
*Draw: delimita contornos para dibujar
+
*Draw: dessiner des contours pour dessiner.
−
*Erase: borra las zonas marcadas con las dos herramientas anteriores
+
*Erase: efface les zones marquées avec les deux outils précédents.
−
*Level tracing: traza zonas de intensidad similar
+
*Level tracing: trace des zones d'intensité similaire.
−
*Grow from seeds: crea segmentaciones a partir de zonas marcadas con la herramienta paint
+
*Grow from seeds: créer des segmentations à partir des zones marquées à l'aide de l'outil de peinture.
−
*Fill between slices: segmenta entre diferentes secciones del volumen
+
*Fill between slices: segmentation entre les différentes sections du volume.
−
*Threshold: umbral. Selecciona zonas de intensidad afín por toda la imagen.
+
*Threshold: seuil. Sélectionne les zones d'intensité correspondante sur l'ensemble de l'image.
  
−
=====segunda fila=====
+
=====Deuxième file=====
 
<figure id="fig:EffectsRow2">
 
<figure id="fig:EffectsRow2">
 
[[File:Fila2.png|center|frame|<caption>Effects row2</caption>]]
 
[[File:Fila2.png|center|frame|<caption>Effects row2</caption>]]
 
</figure>
 
</figure>
  
−
*Margin: amplía o contrae la selección en un incremento fijo
+
*Margin: élargit ou contracte la sélection par incrément fixe.
−
*Smoothing: suaviza la superficie de la selección, eliminando bultos y agujeros. Tiene varios parámetros de acplicación:
+
*Smoothing: adoucit la surface de la sélection, éliminant les bosses et les trous. Il a plusieurs paramètres d'application :
−
**Median: elimina pequeños detalles preservando lo máximo posible el contorno.
+
**Median: élimine les petits détails tout en préservant au maximum le contour.
−
**Opening: elimina bultos de tamaño inferior al especificado.
+
**Opening: élimine les grumeaux plus petits que la taille spécifiée.
−
**Closing: rellena agujeros de tamaño inferior al especificado.
+
**Closing: comble les trous plus petits que la taille spécifiée.
−
**Gaussian: suaviza todos los contornos, a costa de contraer el segmento.
+
**Gaussian: adoucit tous les contours, au prix de la contraction du segment.
−
**Joint smoothing: se aplica a múltiples segmentos simultáneamente, para suavizarlos y eliminar espacios entre ellos.
+
**Joint smoothing: est appliqué à plusieurs segments simultanément, afin de les lisser et d'éliminer les écarts entre eux.
−
*Scissors: corta (elimina) partes de la selección
+
*Scissors: coupe (enlève) des parties de la sélection
−
*Islands: manipula las superficies independientes dentro de la segmentación. Sus ajustes se listan a continuación, y su efecto variará en función de la máscara que se utilice: everywhere (en todas partes), inside all segments (afecta únicamente a las segmentaciones), inside all visible segments (afecta únicamente a las segmentaciones visibles), outside all segments (afecta únicamente a lo que no forme parte de la segmentación) y outside all visible segments (afecta únicamente a lo que no forme parte de la segmentación visible).
+
*Islands: manipule les surfaces indépendantes à l'intérieur de la segmentation. Ses paramètres sont énumérés ci-dessous, et leur effet varie selon le masque utilisé: everywhere (partout), inside all segments (n'affecte que les segmentations), inside all visible segments (n'affecte que les segmentations visibles), outside all segments (n'affecte que ce qui ne fait pas partie de la segmentation) et outside all visible segments (n'affecte que ce qui ne fait pas partie de la segmentation visible).
−
**Keep largest island: conserva la isla de mayor tamaño
+
**Keep largest island: conserve la plus grande île
−
**Remove small islands: elimina todas las islas de tamaño inferior al especificado
+
**Remove small islands: supprime toutes les îles sous-dimensionnées
−
**Split islands into segments: separa las islas en segmentos
+
**Split islands into segments: sépare les îles en segments
−
**keep selected island: conserva la isla seleccionada
+
**keep selected island: conserve l'île sélectionnée
−
**Remove selected island: elimina la isla seleccionada
+
**Remove selected island: efface l'île sélectionnée
−
**Add selected island: añade la isla seleccionada a la segmentación en la que se esté trabajando
+
**Add selected island: ajoute l'île sélectionnée à la segmentation sur laquelle vous travaillez.
−
*Logical operators: operaciones con operadores lógicos entre segmentaciones
+
*Logical operators: opérations avec des opérateurs logiques entre les segmentations.
−
**Copy: reemplaza el segmento seleccionado por el modificador
+
**Copy: remplace le segment sélectionné par le modificateur
−
**Add: añade el segmento modificador al seleccionado
+
**Add: ajoute le segment modificateur au segment sélectionné
−
**Subtract: resta la al segmento seleccionado el modificador
+
**Subtract: soustrait celui au segment sélectionné par le modificateur.
−
**Intersect: intersecta el segmento seleccionado con el modificador
+
**Intersect: croise le segment sélectionné avec le modificateur.
−
**Invert: invierte el segmento seleccionado
+
**Invert: inverse le segment sélectionné
−
**Clear: borra el segmento seleccionado
+
**Clear: efface le segment sélectionné
−
**Fill: rellena el segmento seleccionado
+
**Fill: remplir le segment sélectionné
−
*Fast marching: Expande el segmento seleccionado a regiones con intensidad similar.
+
*Fast marching: Étend le segment sélectionné à des régions d'intensité similaire.
−
*Flood filling: relleno de área por ''inundación'' a través de los vóxeles con intensidad similar
+
*Flood filling: remplissage de la zone par ''inondation'' à travers les voxels avec une intensité similaire.
  
 
=====tercera fila: extra effects=====
 
=====tercera fila: extra effects=====
Línea 81: Línea 82:
 
</figure>
 
</figure>
  
−
*Mask volume: Utilice el segmento seleccionado como máscara. La máscara se aplica al volumen maestro por defecto.
+
*Mask volume: Utilisez le segment sélectionné comme masque. Le masque est appliqué au volume maître par défaut.
−
La operación de llenado interior y exterior crea un volumen de mapa de etiquetas binario como salida, con los valores de llenado interior y exterior modificables. (de la descripción de la herramienta)
+
L'opération de remplissage intérieur et extérieur crée un volume de carte d'étiquettes binaire en sortie, les valeurs de remplissage intérieur et extérieur pouvant être modifiées. (à partir de la description de l'outil)
−
*Surface cut: Use marcas de referencia para rellenar un segmento. La superficie se genera a partir de los puntos colocados. (de la descripción de la herramienta)
+
*Surface cut: Utilisez des marques de référence pour remplir un segment. La surface est générée à partir des points placés. (à partir de la description de l'outil)
−
*Watershed: Crece segmentos para crear una segmentación completa. Se tienen en cuenta la ubicación, el tamaño y la forma de los segmentos iniciales y el contenido del volumen maestro. Los límites finales del segmento se colocarán donde el brillo del volumen maestro cambia bruscamente. (de la descripción de la herramienta)
+
*Watershed: Il développe des segments pour créer une segmentation complète. L'emplacement, la taille et la forme des segments initiaux et le contenu du volume maître sont pris en compte. Les limites finales des segments seront définies lorsque la luminosité du volume maître change brusquement. (à partir de la description de l'outil)
  
−
==Documentación en Slicer.org==
+
==Documentation en Slicer.org==
  
−
[[http://slicer.readthedocs.io/en/latest/user_guide/module_segmenteditor.html Segment Editor]] (en inglés)
+
[[http://slicer.readthedocs.io/en/latest/user_guide/module_segmenteditor.html Segment Editor]] (en anglais)
  
−
== Flujo de trabajo ==
+
== Flux de travail ==
  
−
Previo a la segmentación
+
Avant la segmentation
  
−
*Con el módulo '''Crop Volume''' comprobar que la resolución en las tres dimensiones es la misma
+
*Avec le module ''Crop Volume'' vérifiez que la résolution dans les trois dimensions est la même.
−
*En ese mismo módulo, ajustar el ROI al área en la que se vaya a trabajar, para así reducir la carga de procesado
+
*Dans le même module, ajuster le ROI à la zone à travailler, afin de réduire la charge de traitement.
  
−
Procedimiento
+
Procédure
  
−
*Crear una nueva segmentación para cada estructura anatómica
+
*Créer une nouvelle segmentation pour chaque structure anatomique.
−
*Delimitarla de forma aproximada con la herramienta '''Paint'''
+
*Délimitez-le grossièrement avec l'outil ''Peinture''.
−
*Repetir los dos pasos anteriores con cada una de las segmentaciones a crear
+
*Répétez les deux étapes précédentes avec chacune des segmentations à créer.
−
*Aplicar el efecto '''Grow from seeds''' para generar automáticamente las segmentaciones
+
*Appliquer l'effet ''Grow from seeds'' pour générer automatiquement les segmentations.
  
−
Refinado
+
Raffiné
−
*Mediante los efectos de la segunda fila de herramientas, ajustar las segmentaciones generadas automáticamente para que se ajusten a la realidad anatómica deseada
+
* En utilisant les effets de la deuxième rangée d'outils, ajustez les segmentations générées automatiquement pour correspondre à la réalité anatomique désirée.
 +
 
 +
== Exemples ===
 +
Les exemples vidéo servent à vous montrer comment fonctionnent les outils de l'éditeur, d'une manière dynamique et pratique.
 +
====Langue sous-titres====
 +
Les vidéos sont présentées sans audio, avec des textes sous-titrés en anglais, français et espagnol. Pour changer la langue des sous-titres affichés, suivez les étapes ci-dessous :
 +
 
 +
'''1.''' Cliquez sur ''settings'' dans la barre de vidéo en bas à droite.
 +
[[File:Sub1.png|center|frame]]
 +
 
 +
'''2.''' Cliquez sur ''Subtitles/CC''
 +
[[File:Sub2.png|center|frame]]
 +
 
 +
'''3.''' Sélectionner l'idiome souhaité
 +
[[File:Sub3.png|center|frame]]
 +
 
 +
===Segmentation d'os===
 +
Présentation des outils  ''Scissors'', ''Threshold'', ''Logical operators'' et ''Islands'' sur un exemple de segmentation des phalanges du pied.
 +
<youtube>https://youtu.be/kZ5-krQcRNQ?cc_load_policy=1&hl=fr</youtube>
 +
 
 +
<hr>
 +
[[Clínicos 3D Slicer/fr| MENU]]

Revisión actual del 12:42 3 sep 2018

Otros idiomas:
English • ‎español • ‎français • ‎português

Module Segment Editor

C'est la version avancée du module éditeur, en cela les outils ont été améliorés et le flux de travail varie car il y a plus de possibilités dans l'interaction avec les données. (Figure 1)

Figure 1: Module Segment Editor

Interface

Le module vous permet maintenant de travailler avec différents ensembles de segmentations, en fonction du volume avec lequel vous interagissez, comme vous pouvez le voir dans les deux premiers menus déroulants de l'interface.

Les segmentations sont générées individuellement, au moyen de la barre de boutons qui apparaît à côté de ces menus.(Figure 2):

Figure 2: Segments bar

Les fonctions de ces boutons sont très intuitives :

  • Ajouter: crée une nouvelle segmentation
  • Supprimer: supprime la segmentation sélectionnée.
  • Spectacle 3D: montre les segmentations 3D actives.
  • Segmentations: conduit au module de ce nom.

Effects

Figure 3: Effects

Les deux premières rangées d'icônes correspondent au module Segment Editor lui-même, mais la troisième est l'extension SegmentEditorExtraEffects, qu'il est recommandé d'installer, car elle complète ce module.

primera fila
Figure 4: Effects row1
  • None: ramène le pointeur à son comportement par défaut.
  • Paint: Peindre (sélectionner) les zones de l'image.
  • Draw: dessiner des contours pour dessiner.
  • Erase: efface les zones marquées avec les deux outils précédents.
  • Level tracing: trace des zones d'intensité similaire.
  • Grow from seeds: créer des segmentations à partir des zones marquées à l'aide de l'outil de peinture.
  • Fill between slices: segmentation entre les différentes sections du volume.
  • Threshold: seuil. Sélectionne les zones d'intensité correspondante sur l'ensemble de l'image.
Deuxième file
Figure 5: Effects row2
  • Margin: élargit ou contracte la sélection par incrément fixe.
  • Smoothing: adoucit la surface de la sélection, éliminant les bosses et les trous. Il a plusieurs paramètres d'application :
    • Median: élimine les petits détails tout en préservant au maximum le contour.
    • Opening: élimine les grumeaux plus petits que la taille spécifiée.
    • Closing: comble les trous plus petits que la taille spécifiée.
    • Gaussian: adoucit tous les contours, au prix de la contraction du segment.
    • Joint smoothing: est appliqué à plusieurs segments simultanément, afin de les lisser et d'éliminer les écarts entre eux.
  • Scissors: coupe (enlève) des parties de la sélection
  • Islands: manipule les surfaces indépendantes à l'intérieur de la segmentation. Ses paramètres sont énumérés ci-dessous, et leur effet varie selon le masque utilisé: everywhere (partout), inside all segments (n'affecte que les segmentations), inside all visible segments (n'affecte que les segmentations visibles), outside all segments (n'affecte que ce qui ne fait pas partie de la segmentation) et outside all visible segments (n'affecte que ce qui ne fait pas partie de la segmentation visible).
    • Keep largest island: conserve la plus grande île
    • Remove small islands: supprime toutes les îles sous-dimensionnées
    • Split islands into segments: sépare les îles en segments
    • keep selected island: conserve l'île sélectionnée
    • Remove selected island: efface l'île sélectionnée
    • Add selected island: ajoute l'île sélectionnée à la segmentation sur laquelle vous travaillez.
  • Logical operators: opérations avec des opérateurs logiques entre les segmentations.
    • Copy: remplace le segment sélectionné par le modificateur
    • Add: ajoute le segment modificateur au segment sélectionné
    • Subtract: soustrait celui au segment sélectionné par le modificateur.
    • Intersect: croise le segment sélectionné avec le modificateur.
    • Invert: inverse le segment sélectionné
    • Clear: efface le segment sélectionné
    • Fill: remplir le segment sélectionné
  • Fast marching: Étend le segment sélectionné à des régions d'intensité similaire.
  • Flood filling: remplissage de la zone par inondation à travers les voxels avec une intensité similaire.
tercera fila: extra effects
Figure 6: Effects row3: extra effects
  • Mask volume: Utilisez le segment sélectionné comme masque. Le masque est appliqué au volume maître par défaut.

L'opération de remplissage intérieur et extérieur crée un volume de carte d'étiquettes binaire en sortie, les valeurs de remplissage intérieur et extérieur pouvant être modifiées. (à partir de la description de l'outil)

  • Surface cut: Utilisez des marques de référence pour remplir un segment. La surface est générée à partir des points placés. (à partir de la description de l'outil)
  • Watershed: Il développe des segments pour créer une segmentation complète. L'emplacement, la taille et la forme des segments initiaux et le contenu du volume maître sont pris en compte. Les limites finales des segments seront définies lorsque la luminosité du volume maître change brusquement. (à partir de la description de l'outil)

Documentation en Slicer.org

[Segment Editor] (en anglais)

Flux de travail

Avant la segmentation

  • Avec le module Crop Volume vérifiez que la résolution dans les trois dimensions est la même.
  • Dans le même module, ajuster le ROI à la zone à travailler, afin de réduire la charge de traitement.

Procédure

  • Créer une nouvelle segmentation pour chaque structure anatomique.
  • Délimitez-le grossièrement avec l'outil Peinture.
  • Répétez les deux étapes précédentes avec chacune des segmentations à créer.
  • Appliquer l'effet Grow from seeds pour générer automatiquement les segmentations.

Raffiné

  • En utilisant les effets de la deuxième rangée d'outils, ajustez les segmentations générées automatiquement pour correspondre à la réalité anatomique désirée.

Exemples =

Les exemples vidéo servent à vous montrer comment fonctionnent les outils de l'éditeur, d'une manière dynamique et pratique.

Langue sous-titres

Les vidéos sont présentées sans audio, avec des textes sous-titrés en anglais, français et espagnol. Pour changer la langue des sous-titres affichés, suivez les étapes ci-dessous :

1. Cliquez sur settings dans la barre de vidéo en bas à droite.

Sub1.png

2. Cliquez sur Subtitles/CC

Sub2.png

3. Sélectionner l'idiome souhaité

Sub3.png

Segmentation d'os

Présentation des outils Scissors, Threshold, Logical operators et Islands sur un exemple de segmentation des phalanges du pied.

MENU

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