Editor

Editor Module

Este módulo se complementa con el Segment Editor. Ambos sirven para segmentar volúmenes, pero el Segment Editor se puede considerar como una versión avanzada del Editor; lo que cambia entre ambos son las herramientas disponibles para trabajar. De hecho en la pantalla del módulo recomienda el uso del módulo Segment Editor. (Figure 1)

Figure 1: Module Editor

Secciones

Al entrar en el módulo Editor se abre un cuadro de diálogo preguntando qué tabla de colores se va a utilizar en el procesado.

Una tabla de color asocia los valores escalares de la imagen médica con el color que se va a utilizar en su representación en Slicer. Determinadas modalidades médicas, como CT, proporcionan valores absolutos que permiten establecer la correlación entre los tipos de tejido y los valores escalares de la imagen. Sin embargo, en otras modalidades como MRI, esto no ocurre porque los valores son relativos; siendo necesario realizar esta correlación de forma semi automática.

Hay más información sobre las diferentes tablas de color disponibles por defecto en Slicer dentro de la documentación del módulo [Colors], en la sección Categories.

Create and Select Label Maps

• Master Volume: contiene las imágenes originales del escáner. Se pueden seleccionar tantos volúmenes diferentes como haya cargados en la escena.
• Merge Volume: contiene las representaciones de la escena, a las que se ha aplicado el mapa de color correspondiente.

Ver Figure 1.

Edit Selected Label Map

primera fila

Figure 2: Module Editor - Toolbar row 1

• Default Tool: permet la sélection des éléments
• Erase Label: Effacer les modifications apportées à l'image
• Paint Effect: Colore la zone sur laquelle tu cliques et glisse sur la souris. Lorsque vous sélectionnez cet outil, les options suivantes s'affichent sous les deux barres d'outils: l'étiquette de la brosse, le rayon de la pointe du pinceau et le comportement de la couleur appliquée. Il fonctionne en cliquant avec le bouton gauche de la souris et en faisant glisser, pour faire un dessin à main levée.
• Draw Effet: similaire au précédent mais basé sur des lignes droites définies en fonction des clics.
• Wand Effect: sélectionnez tous les pixels de couleur similaire, en fonction du jeu de tolérance, lorsque vous cliquez dessus.
• Level Tracing Effect: délimite avec une ligne tous les pixels dont la valeur est similaire à celle sélectionnée et clique gauche pour exporter la ligne de contour vers la carte d'étiquette.
• Rectangle Effect: faire une sélection avec une forme rectangulaire en cliquant avec le bouton gauche et en faisant glisser, relâcher ferme le rectangle.
• Identify Islands Effect: applique une étiquette unique à l'ensemble de la zone interconnectée dans la carte de l'étiquette. Dans le cas où il y a d'autres zones avec les mêmes valeurs, mais pas connectées à celles sélectionnées, elles ne seront pas modifiées ou sélectionnées.
• Change Island Effect: applique une couleur différente au contour fermé sélectionné.
• Remove Islands Effect: supprime tous les pixels / voxels non étiquetés dans une zone marquée et les remplace par des valeurs identiques à celles de la zone marquée. Il est utilisé pour éliminer trous / bruit dans les sélections.
• Save Island Effect: se comporte comme l'outil précédent et permet également d'enregistrer la sélection pour des utilisations ultérieures.

Deuxième file

Figure 3: Module Editor - Toolbar row 2

• Erode Effect: réduit la sélection le nombre de pixels définis dans les options de l'outil.
• Dilate Effect: étend la sélection le nombre de pixels définis dans les options de l'outil.
• Grow Cut Effect: se compose d'un algorithme qui segmente en fonction de plusieurs étiquettes de couleur pour séparer automatiquement les zones appartenant aux structures anatomiques sélectionnées.
• Watershed from Marker Effect: Algorithme similaire au précédent, utilisé lorsque des objets avec des bords bien définis sont disponibles.
• Threshold Effect: Définit les portées pour les valeurs seuils qui seront utilisées lors de la peinture, par exemple. Un seuil supérieur et inférieur est défini.
• Change Label Effect: pour changer chaque pixel / voxel dans la carte d'étiquette d'entrée à la valeur de la carte d'étiquette de sortie (du volume principal au volume de fusion).
• Make Model Effect: crée automatiquement des modèles pour toutes les valeurs autres que zéro dans la carte des étiquettes.
• Fast Marching Effect: vous permet de sélectionner par un algorithme de segmentation, des zones de valeurs similaires à celles définies comme valeur de graine automatiquement.

Documentation en Slicer.org

[Editor] (en anglais)