Carregar uma cena
Carregar ficheiros
Há duas maneiras de abrir ficheiros em Slicer:
- Utilizando o menu File|Add Data
- Premindo o primeiro botão da barra de ferramentas, que contém o texto DATA
A janela que se abre é:
As opções são: carregar um único ficheiro ou carregar o conteúdo de uma pasta. Seleccionando a opção de Choose directory to add mostra-nos todos os ficheiros contidos na pasta. Ao premir o botão temos de indicar a rota no disco duro do diretório onde estejam nossos ficheiros e seleccionar a opção *Choose. Então a janela mostrará os arquivos compatíveis com Slicer contidos na pasta:
Por defeito todos os ficheiros aparecem seleccionados. Podem-se seleccionar/desmarcar todos ao mesmo tempo com o icone que há imediatamente embaixo do botão Choose directory to add, marcado em verde na imagem. Se queremos seleccionar unicamente um ficheiro, a maneira mais rápida consiste em desmarcar todos e depois marcar o icone junto ao nome do arquivo que se deseje seleccionar. Uma vez feito isto, pulsando o botão OK carregará o ficheiro em Slicer.
Se não se quer utilizar nenhum dos arquivos da pasta ou desejamos seleccionar outra pasta, com utilizar o botão Reset, a lista de ficheiros mostrada apagar-se-á.
Servidores PACS
O sistema [PACS] (Picture Archiving and Communication System) permite o armazenamento e distribuição de imagens médicas. Ele tem sua parte de hardware, que são os discos rígidos em que as informações são armazenadas fisicamente e o computador que as hospeda, e sua parte de software, que é responsável por gerenciar e transmitir informações entre os usuários. Esses sistemas são instalados em hospitais, facilitando o acesso à imagem médica por qualquer profissional envolvido no tratamento do paciente e permitindo o acesso tanto ao histórico quanto a todos os conjuntos de imagens resultantes de exames médicos realizados.
O sistema PACS trabalha segundo o standard médico de imagem DICOM (Dicom Imaging and Communications in Medicine). Este standard permite a compatibilidade entre as imagens médicas obtidas por diferentes scaners (ainda que os fabricantes introduzam pequenas variantes em seus modelos, a compatibilidade mantém-se), software e impressoras (impressoras radiológicas, por exemplo).
Para aceder aos ficheiros armazenados num servidor PACS é necessário estar registado e dispor dos dados de acesso ao mesmo.
Arrastar e soltar
Outra maneira rápida de abrir ficheiros consiste, desde o navegador de arquivos do sistema operativo, arrastar o ficheiro que se queira abrir até a janela de Slicer e o soltar aí.
Tipos de arquivos
Volume
Gratículas estruturadas voxel.
NRRD
Corresponde a Nearly R aw Raster D ata, é um formato de arquivo para representação e processamento de imagens rasterizadas ( raster ) em 2 e 3 dimensões.
MHA / MHD
São dois formatos de meta-imagem, contendo informações de imagem e rótulos de texto.
MHD
É um formato de meta-imagem, usado principalmente para rótulos de texto de imagens médicas. Desenvolvido por [[1]].
DICOM
É o formato padrão de imagem médica por excelência, com o qual a grande maioria dos fabricantes e software opera.
Modelo
Consistindo em malhas poligonais e superfícies 3D.
VTK
Cada arquivo vtk corresponde a um sólido. No caso da anatomia, cada órgão / estrutura é geralmente colocado de forma independente em um arquivo, a fim de facilitar as interações com eles. [Definição]
STL
Corresponde a Standard Triangle Llinguagem. É um formato para construção de objetos 3D baseados em malhas de triângulos; ele fornece apenas as informações espaciais, não incluindo o restante das propriedades físicas que podem ser associadas ao objeto representado.
Mistos
São aqueles que contêm tanto volumes como modelos.
MRML
Corresponde a Medical Reality Markup Language; baseado em XML, inclui referências a conjuntos de dados 3D e propriedades de cena, utilizados para construir a cena dento do programa. É o formato nativo de Slicer para guardar todos os elementos de uma cena num único ficheiro.
Guardar uma cena
Para guardar uma cena, vai-se ao menu File|Save, o atalho de teclado Ctrl+S ou o botão SAVE da barra de ferramentas (o terceiro começando pela esquerda).
Fechar uma cena
Quando se terminou de trabalhar com a cena, para a fechar, se utiliza a opção File|Close Scene ou a combinação de teclas Ctrl+W. Isto deixa a janela de Slicer tal qual estava: com os módulos e a disposição de janelas (layout) com a que se estivesse a trabalhar, mas sem os dados que tinha abertos.
