Ver el código de «Módulos y extensiones/pt»

__NOTOC__ __NOEDITSECTION__
<languages />
==Módulo ''Anotações''==

Permite realizar anotações sobre elementos da cena, tais como medidas e regiões de interesse (ROI: ''Region Of Interest'''). As medidas, como seu nome indica, permitem conhecer o tamanho e dimensão de partes da imagem. Uma região de interesse é uma área tridimensional em forma de prisma retangular; ao definir as regiões de interesse, pode-se restringir a renderização da zona seleccionada, para aliviar carga processada e assim trabalhar unicamente com a informação contida nesta zona.

(<xr id="fig:ModuleAnnotations" />)
<figure id="fig:ModuleAnnotations">
[[File:ModuleAnnotations.png|center|frame|<caption>Module Annotations</caption>]]
</figure>

==Documentação em Slicer.org==

[[https://www.slicer.org/wiki/Documentation/4.8/Modules/Annotations Annotations]] (en inglés)

===Modulo Data===
A função deste módulo é a de listar os objectos da cena actual e permite operações genéricas sobre eles (procurar, renomear, apagar, mover) dentro da árvore da estrutura do MRML. Mostra os objectos (nós)como estão ordenados na cena e permite ter uma visão geral da mesma.


<figure id="fig:ModuleData1">
[[File:ModuleData01.png|center|frame|<caption>Module Data</caption>]]
</figure>

A janela do módulo tem três ''tab''s: 
*''Subject hierarchy'': mostra a hierarquia dos diferentes elementos (<xr id="fig:ModuleData1" />)
*''Transform hierarchy'': mostra as diferentes transformações existentes na cena (<xr id="fig:ModuleData2" />)
*''All nodes'': mostra a listagem de todos os nós presentes na cena

====Menus contextuais==== 


O ícone que se enontra à esquerda de cada um dos elementos indica-nos o seu tipo, que pode ser: modelo, vista de cena, volume, dados DICOM. 

====Elementos==== 

Clicando com o botão direito sobre um elemento abre-se o menu contextual (<xr id="fig:ModuleDatacontext" />) para interactuar com elementos da cena:


<figure id="fig:ModuleDatacontext">
[[File:ModuleDataContextMenu.png|center|frame|<caption>Moodule Data - context menu object</caption>]]
</figure>


*''Create child folder'': cria uma pasta, dependente do elemento seleccionado, onde localizar os elementos que se desejem. Para mover um elemento basta com manter pulsado o botão esquerdo do rato sobre ele e o arrastar a sua nova posição.
*''Clone'': cria uma cópia do elemento seleccionado
*''Export to DICOM'': para exportar em formato DICOM o elemento seleccionado, ou a cena completa, se marca-se a lacuna de selecção circular correspondente na parte superior da janela. (<xr id="fig:ModuleData1" />)
<figure id="fig:ModuleDataDICOM">
[[File:ModuleDataDICOM.png|center|frame|<caption>Module Data - DICOM</caption>]]
</figure>
*''Rename'': para mudar o nome do elemento seleccionado
*''Delete'': elimina o elemento seleccionado da cena. Atenção: ao executar esta ordem não se abre nenhum menu de confirmação, de modo que se se dá o caso de um clique acidental o elemento fica apagado.
*''Edit properties'': transporta-nos ao módulo [[Models]] para modificar as opções do elemento
*''Select role'': para seleccionar o comportamento do elemento

====Pastas==== 

Clicando com o botão direito sobre um elemento abre-se o menu contextual (<xr id="fig:ModuleDatacontext2" />) para interactuar com elementos da cena:


<figure id="fig:ModuleDatacontext">
[[File:ModuleDataContextMenu.png|center|frame|<caption>Module Data - context menu object</caption>]]
</figure>

Só se descrevem os elementos do menu contextual diferentes aos descritos no menu contextual de objecto
*''Create child folder'': criar uma subpasta
''Show volumes in branch'': destaca na janela da vista 3D os elementos da pasta
*''Convert folder to subject'': muda o comportamento da pasta dentro da cena, convertendo-a num ''sujeito''
*''Convert folder to study'': reverte a mudança anterior, ou modifica um ''sujeito'' a pasta

===Aba ''Transform hierarchy''=== 

<figure id="fig:ModuleData2">
[[File:ModuleData02.png|none|thumb|<caption>Módulo Data - Transform hierarchy</caption>]]
</figure>


Nesta pestana mostram-se as transformações de visualização e de coordenadas existentes na cena. Mediante o menu contextual podem-se modificar, criar novas e consultar as suas propriedades, o qual nos leva ao módulo [[Transforms]]

==Documentação em Slicer.org==

[[https://www.slicer.org/wiki/Documentation/Nightly/Modules/Data Data Module]] (en inglés)

==Módulo ''DataStore''== 

Este módulo permite aceder a sets de dados, tanto sem conexão (aqueles armazenados no computador) como em linha (aqueles contribuídos pela comunidade de Slicer).

Ao aceder a ele se abre uma nova janela, organizada em três abas:

===Local datasets=== 

Mostra os sets de dados que se tenham descarregado previamente ou aqueles que se tenham gerado localmente. É o conteúdo da pasta de dados do Slicer no disco duro local.

Para cada conjunto de dados temos a opção de carregar na cena com o botão '''Load''' ou de apagar com o botão '''Delete'''.

===''Download datasets''===

Para descarregar conjuntos de dados publicamente disponíveis na comunidade Slicer. Estes dados são gratuitos. (<xr id="fig:ModuleDaStore1" />)

<figure id="fig:ModuleDaStore1">
[[File:ModuleDatastore01.png|center|frame|<caption>Module DataStore</caption>]]
</figure>

A parte esquerda da janela é o menu de navegação, onde aparecem as diferentes categorias e os modos das organizar; parte da direita mostra os conjuntos de dados disponíveis segundo os filtros aplicados no menu de navegação. Ao clicar no nome ou a imagem que ilustra o conjunto de dados, nos leva a uma página com uma breve descrição do mesmo (data de criação, tamanho do ficheiro, número de descargas, URL). Ao clicar no botão '''DOWNLOAD''' procede-se à descarga no computador (o que fará que se mostre depois na pasta ''Local Datasets''). Os conjuntos de dados estão avaliado pelos utentes, de 0 a 5 estrelas.

Uma vez finalizada a descarga, volta-se à janela do módulo e podem-se carregar os dados. (<xr id="fig:ModuleDaStore2" />)

<figure id="fig:ModuleDaStore2">
[[File:ModuleDatastore02.png|center|frame|<caption>Module DataStore - files</caption>]]
</figure>

===''Upload Datasets''===
Para poder subir dados aos servidores é necessário estar registado como utente. Outra vantagem de estar registado como utente é que permite também comentar e votar sobre os jogos de dados existentes.

==Documentação em Slicer.org== 

[[https://www.slicer.org/wiki/Documentation/4.6/Modules/DataStore DataStore]] (en inglés)

==Módulo DICOM== 

Este módulo permite importar e exportar informação em formato DICOM desde um servidor ou de forma local, editando a informação adicional que leva este formato de arquivo.

El formato '''DICOM''' es gestionado desde la [[http://www.nema.org/pages/default.aspx|NEMA]], en la división de [[http://www.medicalimaging.org/|Medical Imaging & Technology Alliance]]. Se puede consultar la documentación sobre este formato aquí[[http://dicom.nema.org/standard.html]] (en inglés)

(<xr id="fig:ModuleDicom01" />)
<figure id="fig:ModuleDicom01">
[[File:ModuleDicom01.png|center|frame|<caption>Module Whatever</caption>]]
</figure

==Documentação em Slicer.org==

[[https://www.slicer.org/wiki/Documentation/4.6/Modules/DICOM DICOM]] (en inglés)

==Módulo ''Models''==
Este módulo apresenta-nos os diferentes componentes da cena: os modelos que a formam. Desde esta janela podem-se modificar suas opções de visualização e seu comportamento visual.

<figure id="fig:Module screen">
[[File:Module_models.png|center|frame|<caption>Module screen</caption>]]
</figure>

Os ícones com o desenho de um olho fechado e aberto são para activar ou desactivar a visualização de todos os objectos da cena de forma simultânea. Para fazê-lo individualmente clica-se no ícone do olho aberto/fechado junto ao nome do elemento. À direita do nome do elemento, num pequeno quadrado, mostra-se a cor do mesmo; fazendo duplo clique nele se pode mudar numa janela de selector de cor.

===''Information''===
O bloco ''information'' apresenta os seguintes dados:

<figure id="fig:Information">
[[File:Module_models2.png|center|frame|<caption>Module screen - information</caption>]]
</figure>

O tipo de malha com a que está formado o objecto, dados sobre suas dimensões (área, volume, número de elementos que o compõem...) e o nome do ficheiro vtk.

===''Display''=== 

<figure id="fig:Display">
[[File:ModuleModels03.png|center|frame|<caption>Module Models - display</caption>]]
</figure>


Nesta secção do menu gere-se a visibilidade do elemento selecionado na lacuna ''visibility'', em que vista se representa e a cor utilizada. Na secção ''3D Display'' controla-se a opacidade do elemento mediante um controle de slider, o modo de representação (superfície, malha e nuvem de pontos).

A secção ''Clipping'' controla o comportamento que terá o objecto ao intersectar com os planos coronal, axial e sagital: ao marcar a lacuna ''clipping'' indicamos que a visibilidade do elemento ver-se-á afectada pela posição desses três planos. Mais abaixo, dentro da janela do módulo, está a secção ''Clipping Planos'', na que se estabelece como influirá a cada um dos planos de corte (o vermelho, amarelo ou verde): se quer-se que seja por união ou interseção, e se se quer que mostre a parte do objecto anterior ao plano ou a posterior ao mesmo.

O resto de parâmetros desta secção do módulo controlam a qualidade do renderização, o material do mesmo e suas condições de iluminação.

==Documentação em Slicer.org== 

[[https://www.slicer.org/wiki/Documentation/Nightly/Modules/Models DataStore]] (en inglés)

==Módulo ''Scene Views''==

Serve para guardar e recuperar o estado das janelas da vista 3D e 2D da cena em diferentes estádios do trabalho com os dados. Estas capturas de ecrã fazem-se com a ferramenta da barra de botões com o ícone de uma câmara.

(<xr id="fig:ModuleSceneView" />)
<figure id="fig:ModuleSceneView">
[[File:ModuleSceneViews.png|center|frame|<caption>Module Scene Views</caption>]]
</figure>

==Documentação em Slicer.org==

[[https://www.slicer.org/wiki/Documentation/Nightly/Modules/SceneViews Scene Views]] (en inglés)

==Módulo ''View Controllers''== 

Este módulo duplica os controles de visualização das janelas 2D e 3D. Todas as modificações que se podem fazer sobre os menus de cada janela se podem fazer directamente desde este módulo se o utente o prefere assim:

(<xr id="fig:ModuleViewC" />)
<figure id="fig:ModuleViewC">
[[File:ModuleViewControllers01.png|center|frame|<caption>Module View Controllers</caption>]]
</figure>

==Documentação em Slicer.org==

[[https://www.slicer.org/wiki/Documentation/4.6/Modules/ViewControllers View Controllers]] (en inglés)

==Módulo ''Volumes''==

A função deste módulo é a de ajustar os parâmetros de representação da vista 3D, permitindo mudar entre diferentes tabelas de cor, motores de renderização e sets de valores pré estabelecidos (estes se organizam segundo o tipo de origem dos dados: CAT, MRI...)

(<xr id="fig:ModuleVolumeR" />)
<figure id="fig:ModuleVolumeR">
[[File:ModuleVolumeRendering01.png|center|frame|<caption>Module Volume Rendering</caption>]]
</figure>

Também se podem gerir parâmetros avançados de renderização e iluminação:

(<xr id="fig:ModuleVolumeR2" />)
<figure id="fig:ModuleVolumeR2">
[[File:ModuleVolumeRendering02.png|center|frame|<caption>Module Volume Rendering - Advanced</caption>]]
</figure>

==Documentação em Slicer.org==

[[https://www.slicer.org/wiki/Documentation/4.6/Modules/Volumes Volumes]] (en inglés)


<hr>
[[Clínicos 3D Slicer/pt| MENU]]