Proyecto espectroscopía - 3DSlicer
Proyecto espectroscopía - 3DSlicer
Investigadores: Francisco Marcano Serrano (ULL). Juan Ruiz Alzola (ULPGC-IAC-GTMA)
Resumen
Implementando espectroscopia de resonancia magnética funcional resuelta en el tiempo 1H con cuantificación del amplio espectro de metabolitos en 3D Slicer.
El objetivo de este proyecto es implementar algoritmos de separación de señal para procesar secuencias de tiempo de generación de imágenes de vóxeles individuales o vóxeles. Una secuencia está compuesta de cuadros con un período de NEX * TR sec cada uno. La salida del procesamiento es una secuencia estimada de espectros con un aumento de la relación señal/ruido (SNR). La secuencia mejorada de SNR podría usarse para extraer la información química cinética de los metabolitos que podría encontrarse en la secuencia original en ausencia ideal de ruido, y mejorar la cuantificación de los metabolitos de baja concentración en cada marco. La cuantificación de la secuencia procesada es realizada por software de terceros.
Los algoritmos han sido desarrollados previamente en Matlab, y se propone su implementación en el marco de la biblioteca numérica y científica de 3D Slicer. También se plantea implementar rutinas de comunicación seguras para interactuar con el software de cuantificación de la aplicación 3D Slicer.
