Carga y visualización de múltiples volúmenes

El Módulo Data

Mediante este módulo se muestran todos los nodos presentes en la escena.

Figure 1: File

Modulo Data

La función de este módulo es la de listar los objetos de la escena actual y permite operaciones genéricas sobre ellos (buscar, renombrar, borrar, mover) dentro del árbol de la estructura del MRML. Muestra los objetos (nodos) tal y como están ordenados en la escena y permite tener una visión general de la misma.

Figure 2: Module Data

La ventana del módulo tiene tres pestañas:

• Subject hierarchy: muestra la jerarquía de los diferentes elementos (Figure 2)
• Transform hierarchy: muestra las diferentes transformaciones existentes en la escena (Figure 6)
• All nodes: muestra el listado de todos los nodos presentes en la escena

Menús contextuales

El icono que se muestra a la izquierda de cada uno de los elementos nos indica su tipo, que puede ser: modelo, vista de escena, volumen, datos DICOM.

Elementos

Haciendo clic con el botón derecho sobre un elemento se abre el menú contextual (Figure 3) para interactuar con elementos de la escena:

Figure 3: Moodule Data - context menu object

• Create child folder: crea un contenedor, dependiente del elemento seleccionado, donde ubicar los elementos que se deseen. Para mover un elemento basta con mantener pulsado el botón izquierdo del ratón sobre él y arrastrarlo a su nueva posición.
• Clone: crea una copia del elemento seleccionado
• Export to DICOM: para exportar en formato DICOM el elemento seleccionado, o la escena completa si se marca la casilla de selección circular correspondiente en la parte superior de la ventana. (Figure 2)

Figure 4: Module Data - DICOM

• Rename: para cambiar el nombre del elemento seleccionado
• Delete: elimina el elemento seleccionado de la escena. Atención: al ejecutar esta orden no se abre ningún menú de confirmación, así que si se da el caso de un clic accidental, el elemento queda borrado.
• Edit properties: nos transporta al módulo Models para modificar las opciones del elemento
• Select role: para seleccionar el comportamiento del elemento

Carpetas

Haciendo clic con el botón derecho sobre un elemento se abre el menú contextual (Figure 5) para interactuar con elementos de la escena:

Figure 5: Moodule Data - context menu folder

Solo se describen los elementos del menú contextual diferentes a los descritos en el menú contextual de objeto

• Create child folder: crear una subcarpeta
• Show volumes in branch: destaca en la ventana de la vista 3D los elementos de la carpeta
• Convert folder to subject: cambia el comportamiento de la carpeta dentro de la escena, convirtiéndola en un sujeto
• Convert folder to study: revierte el cambio anterior, o modifica un sujeto a carpeta

Pestaña Transform hierarchy

Figure 6: Module Data - Transform hierarchy

En esta pestaña se muestran las transformaciones de visualización y de coordenadas existentes en la escena. Mediante el menu contextual se pueden modificar, crear nuevas y consultar sus propiedades, lo cual nos lleva al módulo Transforms

Documentación en Slicer.org

[Data Module] (en inglés)

Módulo Volumes

La función de este módulo es la de ajustar los parámetros de representación de la vista 3D, permitiendo seleccionar diferentes tablas de color, motores de renderización y sets de valores preestablecidos (estos vienen en función del tipo de origen de los datos: CAT, MRI...). Si hubiera diferentes volúmenes cargados en la escena, desde este módulo se puede trabajar de forma individual con el seleccionado.

Antes de la sección Volume Information, dentro del panel de módulo, está el desplegable para seleccionar el volumen entre todos los presentes en la escena (Figure 7). Entre las opciones posibles está la de renombrar y borrar el volumen.

Sección: Volume Information

Figure 7: Module Volume Rendering

De entre los parámetros que muestra este módulo tenemos:

• Dimensiones de la imagen: los dos primeros números dan el ancho x largo de cada sección y el tercer número indica cuántas secciones ha;, este tamaño está indicado en el sistema de coordenadas IJK
• Espaciado: se puede asimilar al tamaño de vóxel, aunque realmente indica el espacio entre el centro de los vóxeles consecutivos, en el sistema RAS.
• Coordenadas origen de la imagen: donde está situada la coordenada origen del sistema IJK
• La matriz de transformación IJK-to-RAS: la matriz de transformación que relaciona estos dos sistemas de coordenadas
• Dirección de escaneado: a lo largo de qué eje y en qué sentido se han tomado las secciones del volumen

También se pueden gestionar parámetros avanzados de renderización e iluminación:

(Figure 8)

Figure 8: Module Volume Rendering - Advanced

Documentación en Slicer.org

[Volumes] (en inglés)

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