Carregamento e visualização de múltiplos volumes

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O Módulo Data

Mediante este módulo mostram-se todos os nós presentes na cena.

Figure 1: File

Modulo Data

A função deste módulo é a de listar os objectos da cena actual e permite operações genéricas sobre eles (procurar, renomear, apagar, mover) dentro da árvore da estrutura do MRML. Mostra os objectos (nós) tal e como estão ordenados na cena e permite ter uma visão geral da mesma.

Figure 2: Module Data

A janela do módulo tem três pestanas:

• Subject hierarchy: mostra a hierarquia dos diferentes elementos (Figure 2)
• Transform hierarchy: mostra as diferentes transformações existentes na cena (Figure 6)
• All nodes: mostra a listagem de todos os nós presentes na cena

Menus contextuais

O ícone que se mostra à esquerda de cada um dos elementos indica-nos o seu tipo, que pode ser: modelo, vista de cena, volume, dados DICOM.

Elementos

Clicando com o botão direito sobre um elemento abre-se o menu contextual (Figure 3) para interactuar com elementos da cena:

Figure 3: Moodule Data - context menu object

• Create child folder: cria um continente, dependente do elemento seleccionado, onde localizar os elementos que se desejem. Para mover um elemento basta manter premido o botão esquerdo do rato sobre ele e o arrastar para a sua nova posição.
• Clone: cria uma cópia do elemento seleccionado
• Export to DICOM: para exportar em formato DICOM o elemento seleccionado, ou a cena completa marca-se com o icone de selecção circular correspondente na parte superior da janela. (Figure 2)

none|thumb|Figure 4: *Module Data - DICOM

• *Rename: para mudar o nome do elemento seleccionado
• *Delete: elimina o elemento seleccionado da cena. Atenção: ao executar esta ordem não se abre nenhum menu de confirmação, de modo que se se dá o caso de um clique acidental, o elemento fica apagado.
• *Edit *properties: transporta-nos ao módulo Models para modificar as opções do elemento
• *Select role: para seleccionar o comportamento do elemento

Pastas

Clicando com o botão direito sobre um elemento abre-se o menu contextual (Figure 5) para interactuar com elementos da cena:

Figure 5: Moodule Data - context menu folder

Só se descrevem os elementos do menu contextual diferentes aos descritos no menu contextual de objecto

• Create child folder: criar uma subpasta

Show volumes in *branch: destaca na janela da vista 3D os elementos da pasta

• Convert folder to subject: muda o comportamento da pasta dentro da cena, convertendo-a num sujeito
• Convert folder to study: reverte a mudança anterior, ou modifica um sujeito a pasta

Pestana Transform hierarchy

Archivo:Moduledata02.png

Figure 6: Module Data - Transform hierarchy

Nesta pestana mostram-se as transformações de visualização e de coordenadas existentes na cena. Mediante o menu contextual podem-se modificar, criar novas e consultar as suas propriedades, o qual nos leva ao módulo Transforms

Documentação em Slicer.org

[Data Module] (em inglês)

Módulo Volumes

A função deste módulo é a de ajustar os parâmetros de representação da vista 3D, permitindo seleccionar diferentes tabelas de cor, motores de renderização e conjuntos de valores preestablecidos (estes vêm em função do tipo de origem dos dados: CAT, MRI...). Se tivesse diferentes volumes carregados na cena, a partir deste módulo pode-se trabalhar de forma individual com o seleccionado.

Antes da secção Volume Information, dentro do painel de módulo, está o desdobrável para seleccionar o volume entre todos os presentes na cena (Figure 7). Entre as opções possíveis está a de renomear e apagar o volume.

Secção: *Volume Information

Figure 7: Module Volume Rendering

Dentre os parâmetros que mostra este módulo temos:

• Dimensões da imagem: os dois primeiros números dão a largura x comprimento de cada secção e o terceiro número indica quantas secções tem;, este tamanho está indicado no sistema de coordenadas IJK
• Espaçamento: pode-se assimilar ao tamanho de vóxel, ainda que realmente indica o espaço entre o centro dos vóxeles consecutivos, no sistema RAS.
• Coordenadas origem da imagem: onde está situada a coordenada origem do sistema IJK
• A matriz de transformação IJK-to-RAS: a matriz de transformação que relaciona estes dois sistemas de coordenadas
• Direcção de scaneado: ao longo de que eixo e em que sentido se tomaram as secções do volume

Também se podem gerir parâmetros avançados de renderização e iluminação:

Figure 8: Module Volume Rendering - Advanced

Documentação em Slicer.org

[Volumes] (em inglês)

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